| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_002947 | 3,824,800 | C→A | A117S (GCT→TCT) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,824,800 | 0 | C | A | 98.7% | 867.0 / ‑0.4 | 237 | A117S (GCT→TCT) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (132/102); total (133/104) | |||||||||||
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Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGATGGCGCCGG > NC_002947/3824654‑3824946 | gTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGACTc < 2:312242/150‑1 (MQ=255)gTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGACTc > 2:3481545/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGACTccac < 1:2294877/150‑1 (MQ=255) 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acCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTgcgc > 1:2845309/1‑150 (MQ=255) gCATGGCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCtttt < 2:4173105/150‑1 (MQ=255) cATGGCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCTCGCTGCGCTTTTc > 2:4910973/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGGCATGACCGCAGACTCCTCCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCa < 2:1088879/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCa < 2:1461467/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGc < 1:964054/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGc < 1:570286/150‑1 (MQ=255) ccGGCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGt > 2:560212/1‑150 (MQ=255) ggaTGCCCGCAGCCTCCACCACCCCGAGGAGGAAGCGGATGCCGATGAGCATGTAGACGTTGCGGACCCTGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGa < 2:2945637/148‑1 (MQ=255) gCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGa > 1:1078300/1‑150 (MQ=255) gCATGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGa > 1:4147086/1‑150 (MQ=255) aTGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAg > 1:1745113/1‑104 (MQ=255) aTGACCGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGATg < 1:4907031/150‑1 (MQ=255) ccGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGATGgcgc > 2:1633943/1‑150 (MQ=255) cGCAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCa < 1:3546781/136‑1 (MQ=255) cAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTa > 2:63871/1‑139 (MQ=255) cAGACTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTa < 1:63871/139‑1 (MQ=255) | GTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGGTAAGCGTGGCAAGGCCGCCCCACAGGATCAGGCAGACGAAGATGAGCTTCTTCACGCTGCGCTTTTCAGCGTAGATGGCGCCGG > NC_002947/3824654‑3824946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |