| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,823,901 | +T | coding (1248/1293 nt) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,823,901 | 1 | . | T | 99.5% | 1533.3 / ‑1.3 | 409 | coding (1248/1293 nt) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base T (216/190); total (218/191) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
GGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CA‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCG > NC_002947/3823753‑3824043 | ggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑Catga < 2:7464270/149‑4 (MQ=255) gtgtCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑Catgag > 1:4649260/1‑145 (MQ=255) gtgtCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑Catgag > 1:38536/1‑145 (MQ=255) tCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTc > 1:6053141/1‑149 (MQ=255) ccACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCt < 2:1698441/149‑1 (MQ=255) cACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTg > 1:3246265/1‑149 (MQ=255) cACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTg < 2:2463755/149‑1 (MQ=255) cACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTg < 2:2892731/149‑1 (MQ=255) cACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTg < 1:1929027/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTgg > 1:7041856/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTggg > 1:6584755/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTggg < 1:4228084/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTggg > 2:5101409/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTggg > 1:3298953/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTggg > 2:1251553/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTgggt < 1:6371976/149‑2 (MQ=255) ccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGa < 1:1012143/149‑1 (MQ=255) ggTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGt > 1:3416251/1‑149 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTa < 1:2228191/149‑1 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTa < 1:219080/149‑1 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTa < 1:1240512/149‑1 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTAtt < 2:5943003/149‑1 (MQ=255) gcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc < 1:2779727/149‑1 (MQ=255) gcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTCTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc < 2:6206172/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAg < 1:6263984/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgc > 2:6525650/1‑149 (MQ=255) aGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGcc < 1:3093865/149‑1 (MQ=255) aGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGcc < 2:5375154/149‑1 (MQ=255) cGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACt < 2:3865533/149‑1 (MQ=255) cGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACt > 2:5049290/1‑149 (MQ=255) cGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACt > 1:1785300/1‑149 (MQ=255) tGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGc > 1:3008915/1‑149 (MQ=255) ccATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAg > 2:4541089/1‑149 (MQ=255) ccATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAg < 1:6468637/149‑1 (MQ=255) aTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTc > 2:7107080/1‑149 (MQ=255) aTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTc > 1:3786380/1‑149 (MQ=255) cAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTCAGCGCCACTGCAGTcag > 2:7512977/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagcag > 1:5544295/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagcag < 2:4078736/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGGACAGGCGATTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagcag < 2:6796390/149‑1 (MQ=255) tcgtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagcag > 2:4750302/1‑148 (MQ=255) cgtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg > 1:4368637/1‑149 (MQ=255) cgtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg > 2:4981689/1‑149 (MQ=255) tcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGca < 2:6021388/149‑1 (MQ=255) cgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCCTTGCAGGTTTCGGAATGGTTCTTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑CT‑GAGGGCTGGGACGGATTGGGCGCAGCGGTAAGCGCCAGTGCAGGCAGCCGCGcag > 2:6563806/1‑148 (MQ=255) cgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcac > 2:7422179/1‑149 (MQ=255) ggACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcacc > 2:4395607/1‑149 (MQ=255) gACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcacca > 2:3365295/1‑149 (MQ=255) aCAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcaccac > 1:7132313/1‑149 (MQ=255) aCAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcaccac > 2:231795/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacac < 2:6270301/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacac < 2:5811599/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacaca > 2:5909899/1‑149 (MQ=255) ggCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacaca < 1:5347647/149‑1 (MQ=255) gTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa < 2:3118747/149‑1 (MQ=255) tttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCCCTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGaa > 1:2844459/1‑149 (MQ=255) tttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGaa < 2:1922106/149‑1 (MQ=255) ttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAAc < 1:5846136/149‑1 (MQ=255) attcAGGACGATTCGCTTGTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGTCGCGAGCTATCGCGCTTGGCCCGG‑CGTT‑GTGGTGTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTATGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCAGGACACATGAACAg < 2:1081019/146‑1 (MQ=255) taCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAgg > 1:4791190/1‑149 (MQ=255) aCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGt < 1:1577142/149‑1 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTaa > 2:4342361/1‑149 (MQ=255) ggACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAag < 1:4431574/149‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAagag > 1:909152/1‑149 (MQ=255) ttCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGgcgc < 1:4946642/149‑1 (MQ=255) cGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCg < 1:7395419/149‑1 (MQ=255) cGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCg < 2:1846776/149‑1 (MQ=255) cttcttCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCggg > 1:4610749/1‑149 (MQ=255) ttcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgc < 2:353973/149‑1 (MQ=255) tcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcc > 2:4703047/1‑149 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc < 1:2554375/149‑1 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc > 1:7454732/1‑149 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc < 2:2207718/149‑1 (MQ=255) aTTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgccc > 1:1467797/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTa < 2:2674445/149‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGc < 2:3754456/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGcc > 1:6622380/1‑149 (MQ=255) tttCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGcccc > 1:7349902/1‑149 (MQ=255) cTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTg > 2:3976367/1‑149 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGa > 2:852939/1‑149 (MQ=255) aaTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg < 2:4217402/149‑1 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGt > 1:2659272/1‑149 (MQ=255) ttCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGc > 1:3616986/1‑149 (MQ=255) ttCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGc > 2:1702226/1‑149 (MQ=255) tCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGAAGCCCCATTGAGGTAGcc > 2:5629237/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccac > 1:5668881/1‑149 (MQ=255) ggCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacc < 2:5215714/149‑1 (MQ=255) ggCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacc > 2:4134559/1‑149 (MQ=255) gCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca > 2:7280542/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAg > 1:5114281/1‑149 (MQ=255) aGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGcc > 1:5768277/1‑149 (MQ=255) gACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCa < 1:2114082/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACg < 2:6618766/149‑1 (MQ=255) cgAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAg > 1:1118095/1‑149 (MQ=255) gAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgc < 1:6779613/149‑1 (MQ=255) aGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgcc > 2:3632953/1‑149 (MQ=255) cgcTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACg > 1:2908350/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCCGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAg > 1:4053751/1‑149 (MQ=255) ccGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAgc > 1:6988941/1‑149 (MQ=255) ccGG‑C‑CATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAgc > 2:1550025/1‑149 (MQ=255) | GGTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGG‑C‑CA‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCG > NC_002947/3823753‑3824043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |