Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,201,211 | C→T | S134S (AGC→AGT) P5S (CCG→TCG) |
xcpU → xcpV → |
type II secretion pathway protein XcpU type II secretion pathway protein XcpV |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,201,211 | 0 | C | T | 98.8% | 303.6 / NA | 86 | S134S (AGC→AGT) P5S (CCG→TCG) | xcpU xcpV | type II secretion pathway protein XcpU type II secretion pathway protein XcpV |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (45/40); minor base A (1/0); total (46/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGCCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGC > NC_002947/1201080‑1201340 | tGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCa < 1:1364529/136‑1 (MQ=255) gCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCAcc < 2:1160589/136‑1 (MQ=255) gCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCAcc < 2:933186/136‑1 (MQ=255) cccAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCg > 2:84656/1‑136 (MQ=255) cAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGAt < 2:929838/136‑1 (MQ=255) cAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGAt > 2:721229/1‑136 (MQ=255) cAAGGGCCTGCACCCCGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCCTGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAAAGGGCCTGGAGTCGCACCGAt > 1:1338008/1‑136 (MQ=255) aGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATgg < 1:721229/136‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATgg < 1:1151238/136‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATgg < 1:771026/136‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATgg < 1:411079/136‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATgg < 1:450750/136‑1 (MQ=255) gggCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGc < 1:174501/136‑1 (MQ=255) cTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCAtgt < 2:217587/136‑1 (MQ=255) gCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTgg < 1:323007/136‑1 (MQ=255) gCACCCGGAATCGCCGGCCAGCCAGCAAACGCGCGTAGTGTTCACGCCGCTTGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTgg < 2:490784/136‑1 (MQ=255) cACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGt < 1:537/136‑1 (MQ=255) aCCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGtt > 2:237998/1‑136 (MQ=255) aCCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGtt > 2:1107492/1‑136 (MQ=255) aCCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGtt > 1:940777/1‑136 (MQ=255) aCCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATCGCATGTGGtt > 1:829198/1‑136 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 1:322080/136‑1 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 1:346674/136‑1 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 2:682359/136‑1 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 1:488146/136‑1 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 2:1325381/136‑1 (MQ=255) gACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGc < 1:1130525/136‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCa > 1:19339/1‑136 (MQ=255) cTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCa > 1:463852/1‑136 (MQ=255) cTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCa > 2:92425/1‑136 (MQ=255) tGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCAt > 1:1366124/1‑136 (MQ=255) gccggccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGa < 1:739736/136‑1 (MQ=255) ggccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagc > 1:469463/1‑136 (MQ=255) ggccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagc > 1:136605/1‑136 (MQ=255) ggccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagc > 1:1151152/1‑136 (MQ=255) gccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagca > 1:293210/1‑136 (MQ=255) ccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagcaa < 1:1081655/136‑1 (MQ=255) ccAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGaagcaa < 2:1289861/136‑1 (MQ=255) cGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAg > 1:645303/1‑136 (MQ=255) cgcgTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGTCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGttt < 2:518796/136‑1 (MQ=255) cgcgTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGttt < 1:335573/136‑1 (MQ=255) gcgTAGTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCAATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTc < 1:270979/136‑1 (MQ=255) gTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGGATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCAc > 2:980653/1‑136 (MQ=255) gTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCAc > 2:1164284/1‑136 (MQ=255) gTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGACGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCaa > 2:1330532/1‑135 (MQ=255) cACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTgg < 2:1156765/136‑1 (MQ=255) cACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTgg > 2:1275379/1‑136 (MQ=255) aCGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGa > 2:1207332/1‑136 (MQ=255) ccgcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGt > 2:652963/1‑136 (MQ=255) gcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTgc > 2:815861/1‑135 (MQ=255) gcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa > 1:1159600/1‑136 (MQ=255) gcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa > 1:263667/1‑136 (MQ=255) gcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa > 1:659085/1‑136 (MQ=255) gcATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa > 1:685112/1‑136 (MQ=255) gCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTa > 1:577444/1‑136 (MQ=255) gCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTa > 1:511505/1‑136 (MQ=255) gCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTa > 1:81087/1‑136 (MQ=255) gcgcAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCt < 1:92425/136‑1 (MQ=255) gcAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTgg > 2:59275/1‑136 (MQ=255) ctggCGGGTTGTGTGCGCGGGCGCGTGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGc < 2:725336/134‑1 (MQ=255) tgtgCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa > 2:962851/1‑112 (MQ=255) tgtgCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGa < 1:962851/112‑1 (MQ=255) tgtgCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCg > 2:745767/1‑136 (MQ=255) gctggcgctggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTg > 2:942054/1‑136 (MQ=255) ctggcgctggGCCGATGGCAGTCAGCAAT‑GGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGc > 1:924858/1‑136 (MQ=255) tggcgctggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGc > 1:1144844/1‑136 (MQ=255) gcgctggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCgg > 2:726483/1‑136 (MQ=255) gcgctggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCgg > 1:1010090/1‑136 (MQ=255) cgctggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTAGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGt > 2:289004/1‑136 (MQ=255) tggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTTGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGAt < 1:289004/136‑1 (MQ=255) tggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGAt < 1:894551/136‑1 (MQ=255) tggGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGAt < 2:291107/136‑1 (MQ=255) ggATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCAcca < 1:193461/135‑1 (MQ=255) cGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCAcca < 2:469463/136‑1 (MQ=255) cGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCAcca < 2:1157278/136‑1 (MQ=255) gCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCAccagccag > 2:799216/1‑136 (MQ=255) cAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGttt > 2:1322210/1‑71 (MQ=255) cAGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGttt < 1:1322210/71‑1 (MQ=255) aGTCAGCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGt < 2:291259/136‑1 (MQ=255) gCAATGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGc > 1:562959/1‑136 (MQ=255) aaTGGGCCTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCAc > 1:349013/1‑136 (MQ=255) cTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACTGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGc > 2:1308276/1‑136 (MQ=255) cTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGc < 1:433408/136‑1 (MQ=255) cTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGc > 2:1288003/1‑136 (MQ=255) cTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGc > 2:1282543/1‑136 (MQ=255) cTGGAGTCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGc < 2:293210/136‑1 (MQ=255) | TGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCGTACTGTTCACGCCGCATGGCTGGGCGCAGGCGGGTAGTGTGCGCTGGCGCTGGGCCGATGGCAGTCAGCAATGGGCCTGGAGCCGCACCGATGGCATGTGGTTAGTGCCATGAAGCAAGCACAGCGTGGTTTCACTCTGCTGGAGGTGACCGTAGCCCTGGCAATCGCTGCCGTGCTGGCGGTGATCACCAGCCAGGTACTGCACCAGCGGC > NC_002947/1201080‑1201340 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |