| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_bme_pgi | 3,440,086 | C→A | G315V (GGC→GTC) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_bme_pgi | 3,440,086 | 0 | C | A | 100.0% | 274.1 / NA | 77 | G315V (GGC→GTC) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (39/38); total (39/38) | |||||||||||
GGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCA > NC_000913_3_bme_pgi/3439948‑3440232 | ggCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGt < 1:624409/150‑1 (MQ=255) gCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTc < 3:49994/150‑1 (MQ=255) tgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCACGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTTCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGcc > 4:278780/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTTCCGTTGACGACCACTCTTACGTTGGCGAATGGCTTTATCCTTTTCAGTAAAAACTTAATCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGTCGGTGGCAAGTTTTCCATGAGCATGACCAGAGGAAGTCCATGGGACGACAg > 4:11753/1‑150 (MQ=255) ggTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACg > 1:234559/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCt < 2:234559/150‑1 (MQ=255) tCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCt < 2:965384/150‑1 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTa > 1:238983/1‑150 (MQ=255) tGACGACCACTCTTACGATGGCGCCTGACCTTATCCTTCTAAGTAACACCTTAACCTGTGATCCGGATACTAGTAAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAt < 3:667400/150‑1 (MQ=255) acgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAtct > 4:353248/1‑150 (MQ=255) acgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAtct > 3:664491/1‑150 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAg < 3:563549/150‑1 (MQ=255) ccACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGt > 1:600335/1‑150 (MQ=255) tctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAaga > 2:750262/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAtttttt < 4:347572/150‑1 (MQ=255) gACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGt > 1:105648/1‑150 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa > 1:115348/1‑104 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa < 2:115348/104‑1 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa > 2:792909/1‑124 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa < 1:792909/124‑1 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAgg > 3:422140/1‑150 (MQ=255) tATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGc > 1:1045571/1‑150 (MQ=255) cTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCATGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCAAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGttt > 4:58541/1‑150 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa < 1:1067204/97‑1 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa > 2:1067204/1‑97 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa > 1:403163/1‑97 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGaa < 2:403163/97‑1 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGGGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAg < 1:750262/150‑1 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTaa > 1:245543/1‑106 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTaa < 2:245543/106‑1 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAt > 4:404795/1‑107 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAt < 3:404795/107‑1 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa < 3:86809/111‑1 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa > 4:86809/1‑111 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGc > 1:367334/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAg < 3:287692/147‑1 (MQ=255) aaaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAg > 4:287692/1‑147 (MQ=255) aCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCaa > 1:978432/1‑150 (MQ=255) ctgcaCCTGTGATCCGGTTACTGCTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCTAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCACGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAAcc < 2:1045571/146‑1 (MQ=255) cTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAAcc > 3:282112/1‑150 (MQ=255) ttAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACTGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCt < 1:932906/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCg < 3:353248/150‑1 (MQ=255) ccTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGt > 2:227873/1‑150 (MQ=255) cTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTa < 4:422140/150‑1 (MQ=255) cTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTa < 4:214711/150‑1 (MQ=255) tgtgACCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCACGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAATTTTTACCAAGGTTAGGCGGTTTAAGGAGCTCACCCTCGGTAc > 2:789554/1‑150 (MQ=255) gtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGTTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa < 4:46523/97‑1 (MQ=255) gtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGTTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCa > 3:46523/1‑97 (MQ=255) aTCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACgg > 3:105311/1‑70 (MQ=255) aTCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACgg < 4:105311/70‑1 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGttt < 4:395118/124‑1 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGttt > 3:395118/1‑124 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAg > 1:63163/1‑128 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAg < 2:63163/128‑1 (MQ=255) tCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGt > 2:947377/1‑150 (MQ=255) cGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTAc < 1:947377/150‑1 (MQ=255) gTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAg > 1:444664/1‑109 (MQ=255) gTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAg < 2:444664/109‑1 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt > 3:189814/1‑97 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGAttttt < 4:189814/97‑1 (MQ=255) gTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCAcc > 2:824281/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCg > 1:150201/1‑150 (MQ=255) 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tttCCAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTaa < 2:150201/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTgat < 1:355944/143‑3 (MQ=255) ccAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTgat > 2:355944/1‑141 (MQ=255) ccAGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGc < 1:824281/150‑1 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGtt > 2:411143/1‑81 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGtt < 1:411143/81‑1 (MQ=255) aGGCGCATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAg < 4:207080/150‑1 (MQ=255) gcgcATGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGtt < 2:978432/150‑1 (MQ=255) aTGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCt > 4:545842/1‑36 (MQ=255) aTGACCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCa > 2:819551/1‑150 (MQ=255) | GGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCA > NC_000913_3_bme_pgi/3439948‑3440232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |