| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 4503516 | 95 (1.030) | intergenic (‑84/‑543) | insG/yjhB | IS4 transposase/putative MFS transporter, membrane protein | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
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tCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACaa > 2:778405/1‑150 (MQ=255) cGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaat > 1:1082519‑M2/1‑124 (MQ=255) tAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatca < 3:495549‑M2/150‑29 (MQ=255) aaCGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcag < 3:294742‑M2/150‑30 (MQ=255) ggATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAg < 1:440225/150‑1 (MQ=255) 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gTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGttttt > 2:611128/1‑131 (MQ=255) cAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttg > 1:336340‑M2/1‑27 (MQ=255) cAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttg < 2:174086‑M2/150‑124 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAAGCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATaaa > 3:382868/1‑150 (MQ=255) tGATCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatt > 3:434949‑M2/1‑23 (MQ=255) tCCTTAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatttag > 2:547232‑M2/1‑20 (MQ=255) cTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATAc > 3:612079/1‑150 (MQ=255) ttAACTGATGGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggccattgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatttagtca < 2:588242‑M2/150‑134 (MQ=255) ttAACTGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgat > 3:51213‑M2/1‑17 (MQ=255) aCTGAGCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggagctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatttagcaacac > 1:642777‑M2/1‑14 (MQ=255) tGATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatttagcaacacgg < 1:132487‑M2/150‑139 (MQ=255) tGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTaa > 2:990785/1‑79 (MQ=255) tGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTaa < 1:990785/79‑1 (MQ=255) gATCGGCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttc > 4:511562‑M2/1‑11 (MQ=255) tCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCa < 1:152178/150‑1 (MQ=255) ggCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGTaaa < 4:518002/150‑1 (MQ=255) gCATTAcagcccggaggctggcatttttaaatcagataaagtcagtcttatgcctggcctttgatctctttacgaccgttgtacggtgctttttcgcccagagcttcttcgatacgaatcagctggttgtatttagcaacacggtcagaa < 1:248383‑M2/150‑145 (MQ=255) gCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGta < 3:574507/118‑1 (MQ=255) cATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGa < 3:32592/150‑1 (MQ=255) | AGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGA > NC_000913_3_bme_pgi/4503367‑4503661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |