| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 1870243 = | 268 (1.210) | 31 (0.160) | 20/176 | 17.7 | 11.5% | intergenic (+5/‑142) | yeaH/yeaI | UPF0229 family protein/putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | 1870272 = | 239 (1.200) | intergenic (+34/‑113) | yeaH/yeaI | UPF0229 family protein/putative membrane‑anchored diguanylate cyclase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_bme_pgi/1870351‑1870243‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggctgat‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC > NC_000913_3_bme_pgi/1870272‑1870370 TGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGAC < 2:2201447/100‑1 GTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACC > 1:3050924/1‑100 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTACAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACC < 2:5126304/99‑1 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACTGTAAGCTAAAAATCAGCCATGCGATAATGACCT > 2:2550149/1‑100 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCT > 2:2704791/1‑100 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCT > 2:827576/1‑100 AAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGG > 1:2146850/1‑100 AAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTG < 2:2567280/99‑1 AGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGC > 1:655755/1‑100 AGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGCAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGC < 1:5363892/100‑1 AGGTTATGCTGTCATATGTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGC < 1:5443368/100‑1 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAGTGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCT < 2:3734315/100‑1 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCT < 2:3930850/100‑1 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCT < 2:4564233/100‑1 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCT > 2:106369/1‑100 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCT > 1:5337642/1‑100 GGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGG > 2:106407/1‑98 GTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTG < 2:2863984/100‑1 GTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTG < 2:2033154/100‑1 TTATGCGGTCATATGTAAAGCGATTGTAAGCTAGTGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGA < 2:1837958/100‑1 TATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGA > 1:5216847/1‑99 ATGCTGTGATATTTAAAGCGATGGGAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTG < 2:3874880/97‑1 ATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT < 1:3401745/99‑1 ATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT < 1:3937964/99‑1 TGCCGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTACGCAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCGGATcg > 2:2172476/1‑98 TTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTG > 2:1581305/1‑100 AAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAAAAAATGAGATAATGTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTATAGCTTACTGTA > 1:5098390/1‑99 ATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATC > 1:1502990/1‑100 TACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCT > 1:3363872/1‑100 ACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTT > 1:1095467/1‑100 ACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTT > 1:1748398/1‑100 CAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTT > 1:4446144/1‑99 CAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTT > 2:4797393/1‑99 CAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATAGCTT > 1:2524090/1‑99 CAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATATATTACATACATTAGCT > 2:5456990/1‑88 GTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTA > 2:357939/1‑99 GTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTA > 1:3580289/1‑99 AAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAA > 1:2257610/1‑99 GCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACAGACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGA > 1:4277869/1‑100 CTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGA > 1:1440806/1‑99 CTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGA > 1:1927382/1‑99 TAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGA > 2:2781942/1‑98 AAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAG > 1:3857933/1‑100 AAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCA > 1:661154/1‑100 AATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCA > 1:1603716/1‑99 ATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTTTTTTTTTTTTAATTATCACATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATAT > 2:1217173/1‑91 ATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCAT > 2:1934881/1‑99 ATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCAT > 2:4332994/1‑99 ATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCAT > 1:5210293/1‑99 TCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAA > 2:967098/1‑100 CAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATAGTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCAT > 1:5547111/1‑99 CAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAAC > 1:3037909/1‑100 CAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCCCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAA > 2:2917122/1‑99 AGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACC > 2:2048453/1‑100 CGATAATGACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTAACTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTA > 2:2247263/1‑97 ACCTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAG < 1:1942546/99‑1 CTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTC < 2:4050547/100‑1 CTGGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTC > 1:3210252/1‑100 GGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTC > 1:1437594/1‑98 GGCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTC > 1:4166771/1‑98 GCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAG < 1:3397331/100‑1 GCTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCA < 2:4949255/99‑1 CTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTACATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCCTAACCTTTACATAATTTAGTTC < 2:5125693/96‑1 CTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAG > 2:2786610/1‑99 CTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAG > 1:3315974/1‑99 CTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTT < 2:3331830/95‑1 CTGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATAGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCTAG > 2:4980295/1‑99 TGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGA > 2:4733992/1‑99 TGAT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGA > 2:1995422/1‑99 TGAT‑‑TTTCAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGA > 2:5468135/1‑99 AT‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAA < 2:5361111/100‑1 T‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC < 2:3919293/100‑1 T‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC < 2:4010195/100‑1 T‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC < 2:2970789/100‑1 T‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC < 2:1640732/100‑1 TGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_bme_pgi/1870351‑1870243‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggctgat‑‑TTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAAC > NC_000913_3_bme_pgi/1870272‑1870370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |