| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 225154 = | NA (NA) | 12 (0.140) | 7/286 | 9.1 | NA | noncoding (1384/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | 225176 = | NA (NA) | noncoding (1406/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_bme_pgi/225306‑225154‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > NC_000913_3_bme_pgi/225176‑225323 GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGG < 1:1157285/149‑1GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCGACGGTTACCTTGTTACGACTTAACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTGATTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGG > 2:284353/1‑149 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC > 2:638251/1‑149 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC < 2:2258/149‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC > 1:444578/1‑149 TGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCCCCCCAGTCATGAATCACTAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTGAGCGAGCTACGTCTTTTGCAACCCCCTCCCATGGTGTGACGGGCGGGGTGTACACGGCC > 1:1000308/1‑149 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCGAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCAGTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCC < 2:911220/149‑1 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCC > 2:1301071/1‑149 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCCTGGTGGGCCGGGCGGTGGGTACAAGGCCC > 2:1218702/1‑149 cTCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACGTGTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGAGGGGCGGTGGGGACAAGGCCCG > 2:809818/2‑149 ATCCAACCGCATGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGAGTTCACCCCAGTCATGAAGCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:436087/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCGTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACAGTCGTAAGCGCCCTCCCGAAGGATAAGCAACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCCTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 2:489534/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGCATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCGCCGTCTTGTGCACCCCACTCCCAGGGTGGGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:813813/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGATTCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:18689/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTGCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTACCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:278675/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGATGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:51952/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTATGCTACCTACTTCTTTTGCCACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:973960/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTATGCTACCGAGTTCTTTTGCAACCCAAGCCCATGGTGTGACGGGGGGGGTGTACAAGGCCCG > 1:822327/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTCCCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCAAGGTGTGACGGTCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:820063/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTGCTTCGTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGGGTGGACTAGGCCCG > 1:826493/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:472293/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 2:330432/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:705939/149‑1 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:727480/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGGAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGGGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:1472159/1‑149 ATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGGAAGCGCCCTCCCGAAGGGTAAGCTACCTAGTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGCCGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:974457/1‑149 TCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCAT > 2:64124/1‑149 CTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGG > 2:431858/1‑149 CATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGTGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGG > 1:152296/1‑149 GACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGG < 1:431858/149‑1 ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCCCTTTGTGATGCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGACCCTGCGGTTGGA > 2:311352/1‑149 ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGACCCTGCGGTTGGc > 1:819095/1‑148 ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGACCCTGCGGTTGGA > 1:493777/1‑149 ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGA > 1:1345496/1‑149 ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGA > 2:35313/1‑149 GGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATC > 1:562025/1‑149 GGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGG > 1:779438/1‑70 GGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGG < 2:779438/70‑1 GCCCGTCC‑‑‑‑‑‑‑CCCCCCGGGAGTGGGTGGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCGTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGCAGTCGTAACAAGGTCACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:1471415/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 1:727203/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:113868/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:530558/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 1:64620/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 1:611981/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 1:516484/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 1:1412508/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACATTGTGATTCATGACTTGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:961139/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAACAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA > 1:1242276/1‑149 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAACAAGTAGGTAGCTAAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGTATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:1161726/149‑1 GCCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGGGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCATCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:841951/149‑1 GCCCGGCC‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCATACCCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:425201/149‑1 GCCCGGCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGCGTGGGGTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA < 2:1035755/149‑1 CCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAG < 1:1457349/149‑1 CCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAG > 1:694000/1‑149 CCCGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAG > 2:719364/1‑149 CGTCC‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTGCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 2:1104992/149‑1 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CTCCTTGGGTGTGGGTTGCAAAAGTAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGTTTACCTCTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 1:325285/149‑1 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGATGGGGTTGCAAAAGAATTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCCTGACTGGGGTGAAGTCGTAACCAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 1:1365959/149‑1 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 2:207972/149‑1 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 2:1373725/149‑1 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTCTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGCTAACCGTAGGGGAACCTGCCGTAGGATCACCTCCTAACCTTAAAGAA > 2:325285/1‑149 CGTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGGGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA < 1:522868/149‑1 GTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG < 1:75476/149‑1 GTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 2:524837/1‑149 GTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 2:1158639/1‑149 GTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 1:1302291/1‑149 GTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 2:1475867/1‑149 GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_bme_pgi/225306‑225154‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgTCA‑‑‑‑‑‑‑CACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > NC_000913_3_bme_pgi/225176‑225323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |