| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2099817 | 136 (1.510) | 9 (0.100) | 8/284 | 8.5 | 6.6% | intergenic (‑204/+45) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2099828 | 123 (1.430) | intergenic (‑215/+34) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AAGAGCTAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAG > NC_000913_3_bme_pgi/2099669‑2099963 | aaGAGCTAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCgg > 2:1067455/1‑149 (MQ=255) cTAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCaa > 1:693614/1‑149 (MQ=255) tAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAat > 1:241040/1‑149 (MQ=255) tAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAat > 2:577437/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACTCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAata < 2:1051177/149‑1 (MQ=255) aaaaGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAata > 1:1090739/1‑149 (MQ=255) aGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATAc < 1:1071771/149‑1 (MQ=255) ttttAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGc < 2:444430/149‑1 (MQ=255) ttttAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGc > 1:120947/1‑149 (MQ=255) aaCGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCggg > 2:683426/1‑149 (MQ=255) aCGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGc < 1:196762/149‑1 (MQ=255) gCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCt > 2:1157900/1‑149 (MQ=255) gCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTAAAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCt > 1:685783/1‑149 (MQ=255) 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cgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt < 1:858763/149‑1 (MQ=255) caacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCa > 2:1430746/1‑149 (MQ=255) gAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGATGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTAAATTTTTTTGTTGGTTAAATCAGAtt > 2:1190920/1‑149 (MQ=255) aaCAATTCAGATTTTATTTATAAGAATAGGGGATATTTATTAAGTAAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACTCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATc < 2:1022631/149‑1 (MQ=255) aaTTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAg < 2:790075/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |