New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 4234159 | 1228 (13.850) | 65 (0.760) | 30/246 | 3.3 | 5.3% | intergenic (‑926/‑1748) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
? | NC_000913_3_bme_pgi | = 4234185 | 1150 (13.500) | intergenic (‑952/‑1722) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/4234006‑4234159 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgg‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGGC < NC_000913_3_bme_pgi/4234185‑4234037 GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT < 1:128159/150‑1 GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT > 1:992085/1‑150 GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT > 2:325390/1‑150 GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT > 2:916893/1‑150 GGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC < 2:723313/150‑1 GGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC > 4:63549/1‑150 GCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCC > 1:283226/1‑150 CGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCG < 1:958044/150‑1 CGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCG < 4:58340/150‑1 ATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG < 2:753399/144‑1 ATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC > 2:524547/1‑141 ATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC < 1:524547/141‑1 AACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCG < 2:668895/150‑1 TACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC < 4:315447/133‑1 CGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAA > 4:190983/1‑150 GAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC < 4:520036/129‑1 CGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGGTCCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGG < 4:574046/150‑1 GCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC > 4:385413/1‑120 GCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATC < 3:385397/120‑1 CCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGGTCCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGAC < 1:851722/150‑1 CGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT‑‑‑‑‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 3:509410/149‑1 CGTACTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT‑‑‑‑‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT > 4:509410/1‑149 GTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGGTCCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCG < 3:223759/150‑1 GTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGG < 2:963857/150‑1 GTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGG < 3:269483/150‑1 TTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGGTCCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGG < 1:912541/150‑1 TTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGA < 2:289983/150‑1 TTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGA < 3:387270/150‑1 TTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCG > 3:621454/1‑118 gCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGGCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATGATGTACTGCCGGATGTGAAACAGGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCGTCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 4:306966/149‑1 TCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 3:51186/150‑1 TCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 4:645542/150‑1 TCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 1:809418/150‑1 CTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATG < 3:285347/150‑1 gGCATGTGGCGCTGCGCGGCTCGTGCTCGAAGGAAGTGCTGGTGGACGGGGATAATGTACTGCCGGAGGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGGTCCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATG < 1:1017976/149‑1 TGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT > 1:397082/1‑148 TGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 2:397082/148‑1 GCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATG > 3:541725/1‑139 GCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATG < 4:541725/139‑1 GCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT > 2:691459/1‑138 GCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGAT < 1:691459/138‑1 TGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT < 2:651092/100‑1 TGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCAT > 1:651092/1‑100 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1:549828/85‑1 CGG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGC > 1:768156/1‑66 GG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGG > 1:1033409/1‑150 GG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGG > 2:507175/1‑150 GG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTC < 1:894911/127‑1 GG‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTC > 2:894911/1‑127 GG‑CCGGTCCCGCCCTTCAACGCGACGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCAAATGTTTCACATCCGGCAGGACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGG > 2:98219/1‑150 G‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGGC > 1:67189/1‑150 G‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGGC > 2:43311/1‑150 G‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGGC > 1:341616/1‑150 GGGCGAGCATATCAACAATACCGAAGACCGCGCCGTTCTGCATGTGGCGCTGCGCGACACGTCCTCGAAGGAAGTGCTGGTTGACGGGCATAATGTACTGCCGGATGTGAAACATGTGCTCGACCGCATGGCCGCTTTTGCGGATGGCATCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/4234006‑4234159 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgg‑CCGGTCGCGCCCTTCAACGCGCCGGACCGGATGCCATCCGCAAAAGCGGCCATGCGGTCGAGCACATGTTTCACATCCGGCAGTACATTATGCCCGTCAACCAGCACTTCCTTCGAGGACGTGTCGCGCAGCGCCACATGCAGAACGGC < NC_000913_3_bme_pgi/4234185‑4234037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |