New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 4234621 = | 1300 (14.660) | 67 (0.800) | 33/242 | 2.7 | 5.4% | intergenic (‑1388/‑1286) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
? | NC_000913_3_bme_pgi | 4234638 = | 1114 (13.300) | intergenic (‑1405/‑1269) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1464 total aligned reads displayed.
GCTGCCGTTTCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTATGACCA > NC_000913_3_bme_pgi/4234472‑4234770 | gctgcCGTTTCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAGGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTc < 1:576862/150‑1 (MQ=255) gctgcCGTTTCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTc > 1:837516/1‑150 (MQ=255) gctgcCGTTTCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTc > 1:653507/1‑150 (MQ=255) aggcgcgaaaggcgctggtcataaggaatgatggcgcggctgccataaccgcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgccc > 2:242413‑M1/149‑150 (MQ=255) gcgcgaaaggcgctggtcataaggaatgatggcgcggctgccataaccgcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgcCCGc < 3:352720‑M1/4‑1 (MQ=255) gcgaaaggcgctggtcataaggaatgatggcgcggctgccataaccgcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgcCCGCaa < 3:503016‑M1/6‑1 (MQ=255) gcgaaaggcgctggtcataaggaatgatggcgcggctgccataaccgcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgcCCGCaa > 4:487363‑M1/145‑150 (MQ=255) tttCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGt > 2:75329/1‑150 (MQ=255) cACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCt > 4:411102/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTgt > 1:197291/1‑149 (MQ=255) cgcTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCgg < 2:215524/150‑1 (MQ=255) gcTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCggg > 1:760342/1‑150 (MQ=255) cTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGGTGGCGTGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGgc < 1:1065419/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGcaca > 3:616211/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGgcg < 4:529234/145‑1 (MQ=255) gCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATg < 3:423293/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGa > 1:310146/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGAtgt < 2:453796/150‑1 (MQ=255) ttCGGCTGTCCTTAAGTGGGTGTTTGCTTCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGTTCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGAtttg < 4:261751/150‑1 (MQ=255) ttCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATgg < 1:525145/145‑1 (MQ=255) ttCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGAtgtg > 4:396737/1‑150 (MQ=255) tCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACGGGGTTGTCGGGCGTTATTCGGTCTGGGCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGc < 3:127531/150‑1 (MQ=255) ggCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCAt > 1:694268/1‑150 (MQ=255) 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tGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGa < 1:814366/150‑1 (MQ=255) gcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgcCCGCaa < 4:22873‑M1/6‑1 (MQ=255) gcagattgcgcgatgccaatagccgatgaggccgagcatgacgggcaggttcttttccagtggcgcatcgcggaaatgcacatccatggcgtgtgcgcCCGCAAg < 1:123572‑M1/7‑1 (MQ=255) gATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCgg < 4:556480/115‑1 (MQ=255) aTCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGTGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATgcgc < 2:126732/150‑1 (MQ=255) aTCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATgcgc < 2:584751/150‑1 (MQ=255) aTCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATgcgc > 2:412816/1‑150 (MQ=255) cGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCGCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCa > 4:624404/1‑150 (MQ=255) cGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTGGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCTGGATAATGTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCa < 3:234707/150‑1 (MQ=255) gtgtTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGcccc > 3:258078/1‑148 (MQ=255) tgtTTTCGGCTTCTGGGACTTGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCTCAATTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACt < 2:98924/150‑1 (MQ=255) ttttCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGca > 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ccGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGca < 2:383192/54‑1 (MQ=255) ccGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGca > 1:383192/1‑54 (MQ=255) cGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTCCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCAGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGtt > 2:731848/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATg < 1:869649/150‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCgg > 4:16200/1‑120 (MQ=255) gatgatCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCgg < 3:16200/120‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATgg < 1:338193/150‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATgg > 3:549145/1‑150 (MQ=255) atCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGc > 2:792522/1‑150 (MQ=255) atCGCCGTCGGCCCAGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTACGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTCCGGTTATGGCAGc > 2:32961/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGaaa > 2:880444/1‑84 (MQ=255) tCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGcc < 1:409743/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGcc > 3:645853/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCa < 2:363137/103‑1 (MQ=255) gCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTg < 1:252436/71‑1 (MQ=255) gCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCCATATGCGGATATGACCGCCGCGCcatca > 2:266995/1‑150 (MQ=255) cccGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGa > 3:294677/1‑77 (MQ=255) ccGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAAc < 4:135776/78‑1 (MQ=255) gATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAAt < 4:68622/119‑1 (MQ=255) aaTTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATcgcg < 3:597915/112‑1 (MQ=255) aaTTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTAt < 1:927537/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTATg > 1:441494/1‑150 (MQ=255) tttCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCCTCATTCCTTATGa > 4:321794/1‑150 (MQ=255) ttCCGCAGGTGCCTTGGGGGCGAACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTATGAc < 2:1023701/150‑1 (MQ=255) CCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTATGACCa < 1:363658‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCTGCCGTTTCCACTGCGCTCGACAAGGTTGCGGCCTTCGGCATTCCTGAAGATCGTGTTTTCGGCTTCTGGGACTGGGTTGGCGGGCGTTATTCGGTCTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGGTGATGATCGCCGTCGGCCCGGATAATTTCCGCAAGTTCCTTGCGGGCGCACACGCCATGGATGTGCATTTCCGCGATGCGCCACTGGAAAAGAACCTGCCCGTCATGCTCGGCCTCATCGGCTATTGGCATCGCGCAATCTGCGGTTATGGCAGCCGCGCCATCATTCCTTATGACCA > NC_000913_3_bme_pgi/4234472‑4234770 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |