| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_bme_pgi | 1,927,949 | A→C | R297R (CGT→CGG) | ptrB ← | protease II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_bme_pgi | 1,927,949 | 0 | A | C | 95.3% | 285.0 / ‑1.3 | 86 | R297R (CGT→CGG) | ptrB | protease II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base C (42/40); total (44/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCCAGCAGGC > NC_000913_3_bme_pgi/1927804‑1928091 | tGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGTATACGGGTCCGGt > 4:637748/1‑150 (MQ=255)tGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGt < 2:874527/150‑1 (MQ=255) cGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGtat < 2:983492/150‑1 (MQ=255) ttAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAg > 1:573860/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCaaa > 4:524167/1‑150 (MQ=255) cAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGttttt < 3:736451/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTg > 3:682046/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTgg < 2:1210462/150‑1 (MQ=255) cgcTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGaa < 1:1059096/150‑1 (MQ=255) cgcTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGaa < 2:573860/150‑1 (MQ=255) cTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGGACg > 1:490910/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt < 3:90156/150‑1 (MQ=255) gCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt > 2:510406/1‑150 (MQ=255) ttCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaaaa > 4:104915/1‑150 (MQ=255) ttCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGACGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTCGCTCATCCCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTCTTGCCGTGTGCGTCGGAACGAAGATaaaa > 4:694428/1‑150 (MQ=255) ttCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACACTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaaaa > 4:105104/1‑150 (MQ=255) caccaGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGt > 4:160008/1‑122 (MQ=255) caccaGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGt < 3:160008/122‑1 (MQ=255) caccaGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATg > 2:156711/1‑150 (MQ=255) ccagccagTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCt < 1:156711/150‑1 (MQ=255) ggTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGAt > 1:15085/1‑137 (MQ=255) ggTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGAt < 2:15085/137‑1 (MQ=255) aaCAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAgg < 1:468789/150‑1 (MQ=255) cAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCt < 4:682046/150‑1 (MQ=255) aGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTg > 4:275075/1‑99 (MQ=255) aGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTg < 3:275075/99‑1 (MQ=255) cGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGt > 1:1160520/1‑80 (MQ=255) cGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGt < 2:1160520/80‑1 (MQ=255) cGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGt > 2:305447/1‑137 (MQ=255) cGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGt < 1:305447/137‑1 (MQ=255) tAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCa > 3:355750/1‑114 (MQ=255) tAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCa < 4:355750/114‑1 (MQ=255) aCCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATaa > 1:43380/1‑79 (MQ=255) aCCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATaa < 2:43435/79‑1 (MQ=255) aCCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATaa < 2:43380/79‑1 (MQ=255) aCCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATaa > 1:43435/1‑79 (MQ=255) ttCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCt < 2:618190/138‑1 (MQ=255) ttCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCt > 1:618190/1‑138 (MQ=255) ttCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCt > 2:185062/1‑138 (MQ=255) ttCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATc > 1:162989/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCt < 1:185062/138‑1 (MQ=255) aGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGc < 2:168588/102‑1 (MQ=255) aGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGc > 1:168588/1‑102 (MQ=255) cATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGttttt > 1:450398/1‑81 (MQ=255) cATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGttttt < 2:450398/81‑1 (MQ=255) cATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcg < 3:524167/150‑1 (MQ=255) tgatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggc > 2:1021616/1‑150 (MQ=255) tgatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggc > 1:1066557/1‑150 (MQ=255) gatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt < 2:168922/101‑1 (MQ=255) gatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt > 1:168922/1‑101 (MQ=255) gatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcg < 1:425145/150‑1 (MQ=255) gatgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcg > 2:1057441/1‑150 (MQ=255) atgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCttt > 3:141640/1‑143 (MQ=255) atgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCttt < 4:141640/143‑1 (MQ=255) atgTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcgc > 2:131887/1‑150 (MQ=255) gTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcgcgg < 1:131887/150‑1 (MQ=255) tCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGa > 3:99675/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGaaaaa < 1:510406/150‑1 (MQ=255) tGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAaaac > 2:1039837/1‑150 (MQ=255) ctctTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGc > 4:49723/1‑150 (MQ=255) ttCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGc < 2:473526/53‑1 (MQ=255) ttCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGc > 1:473526/1‑53 (MQ=255) cccACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgc > 2:566785/1‑117 (MQ=255) cccACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgc < 1:566785/117‑1 (MQ=255) ccACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcgcggc > 3:696827/1‑124 (MQ=255) ccACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTgcggcgcggc < 4:696827/124‑1 (MQ=255) cACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCa < 2:363197/67‑1 (MQ=255) cACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCa > 1:363197/1‑67 (MQ=255) tGCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTcc < 2:1066557/150‑1 (MQ=255) gCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAaaac > 4:73046/1‑124 (MQ=255) gCTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAaaac < 3:73046/124‑1 (MQ=255) cTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCcgc < 3:105104/150‑1 (MQ=255) cTCATCACGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCcgc < 3:104915/150‑1 (MQ=255) tcatcaCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCcgcg > 2:390862/1‑150 (MQ=255) catcaCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGt > 4:246767/1‑150 (MQ=255) catcaCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGt < 1:1021616/150‑1 (MQ=255) caCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCca < 1:83346/150‑1 (MQ=255) aCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCcag > 2:752704/1‑150 (MQ=255) aCGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCcag < 1:390862/150‑1 (MQ=255) cGCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCcagc > 4:538296/1‑150 (MQ=255) gCATACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCcagca > 1:301117/1‑150 (MQ=255) aTACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGCTCAAGGCTGTATTCGTGa > 1:1068386/1‑90 (MQ=255) aTACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGa < 2:1068386/90‑1 (MQ=255) tACGGGTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCCAGCAGGc < 1:1057441/150‑1 (MQ=255) gggTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGcc < 3:529426/128‑1 (MQ=255) gggTCCGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGcc > 4:529426/1‑128 (MQ=255) | TGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAACGGCTCGGCATCGGCCATTTCCGCGTCCAGCAGGC > NC_000913_3_bme_pgi/1927804‑1928091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |