| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 2515613 | NA (NA) | 61 (0.820) | 51/290 | 0.5 | 91.2% | intergenic (+170/+30) | insL1/yfeA | IS186 transposase/putative diguanylate cyclase |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4543644 | 6 (0.080) | coding (502/549 nt) | fimA | major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
ATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_pgi/2515466‑2515613‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGTTGCG < NC_000913_3_hsa_pgi/4543644‑4543496 ATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGTCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:700538/149‑1ATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACTCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:126998/149‑1ATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:515559/149‑1ATGGTCAGCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCATGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:515564/149‑1 TGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:610250/149‑1 TGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:297699/149‑1 GGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:286122/149‑1 ATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGC < 2:784003/149‑1 GGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGTCC > 2:1128208/1‑149 GCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGCCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCCGCCCCGGGTGCAAAAga > 2:509529/1‑147 GCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACTAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATA > 2:972258/1‑149 CCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGCGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAA > 2:1104595/1‑149 CCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAA > 2:1244805/1‑149 aaTCGTGCGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTCAAGAACGCGAGGCATCCTCTACACGATGCACCGAGGCGAAGCAGTCTTAAGATGGTACAACCCTTAAGATAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGCTTGCAAAATAACc > 2:1130818/3‑148 ATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAAGGCAATTGAAGAACGCGAGGAATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGTTTAAAGCCTTAAGTTAGCTCTTTTGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAACTAACG > 2:118038/1‑149 ATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACG > 2:936665/1‑149 CGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGC < 2:426421/149‑1 TGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCT < 1:903921/149‑1 ATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGAATTCTTCAGATGGTTCAACCATTAAGTTAGCGCTTATTGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCTCCTGGAACGGAA > 2:201319/1‑149 TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTA > 1:969226/1‑149 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTAT > 2:506041/1‑149 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGG > 2:607154/1‑149 cttCAAAACGGAATTGAAGAACTGGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCATATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTCTGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTC < 1:1053027/146‑1 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGT < 1:1245618/149‑1 agGCACTTGAAGAACTCGAGGCATCGTCGTACCGCGGCACCGTGGCGTCGCTTTGTTCAGATGGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATTACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTGCCGTTATT < 2:1104285/147‑1 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTC > 1:603213/1‑149 CGCAACTGAAGACCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCATATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTC < 1:1222426/149‑1 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCA > 2:183571/1‑149 AATTCAAGACCGCGAGGCAGCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGG < 1:1031569/149‑1 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTG < 1:885247/149‑1 AAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAAAAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTACCGTTATTCAGGGTTGT > 1:1054984/1‑149 AACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTC < 1:565092/149‑1 ACGCGAGGCATCGTCTTAACGCGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGGTGTTTCT < 2:435175/149‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGATTGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGA < 1:1244805/149‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTGCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGGTGTTTCTGA < 1:1104595/149‑1 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAAC < 1:164822/149‑1 attGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAAT > 2:769918/4‑149 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAAT > 1:1039564/1‑149 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAAT < 1:972258/149‑1 gCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGGCGTTTCTGAACTAAATGTCG < 2:1225673/148‑1 CTTAACGAGGCTCCGCGGCGGGGCATTCTTCAGATGGTTCATCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGCGGCCCCGGTTGCTAAATAACGCGCATTGAAGGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGC < 1:677434/149‑1 CTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAACTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGC < 2:464191/149‑1 TTAATGAGGCACCGCTGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCA < 1:1238568/149‑1 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAATATAAAGCTCCTGGAACGGAATCGTATTGGTTACGTTATTCAGGGATGTTTCTGAACTAAATGTCTCAC > 1:227759/1‑149 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACC > 1:952483/1‑149 ACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCA > 1:1054040/1‑149 GGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCA < 1:509529/149‑1 GCACAGAGGCGACGCATTCTTCAGATGGTTCAACCAGTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTCGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTAATCAGGGTTGGTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAG > 2:34815/1‑149 GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGGTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCG < 2:729797/149‑1 GCATTCTTCAGATGGTTCTACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTAATGGTTCCGTTATTAACGGTTGTTACTCAACTAAATCTCCCACCAACCAGCGTCAGCTCAGaa > 2:378073/1‑147 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACC > 1:1198275/1‑149 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTC > 1:158218/1‑149 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTG > 1:988288/1‑149 taacgcTCATCCCTTAAGTTAGCGCATATGGGTTGCGGCCCCGGCTCCAAAATAACCCGCCGCCAACGGAATGGTATTGGTTCCGATATTCAGGGTTGCTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGT < 2:819787/143‑1 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCATATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTACGTTATTCAGGGATGTTTCAGAACTAAATGTCGCACAATCCAGCGTAAGAGAAGCAACCGTTCTGT > 1:721876/1‑149 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAG < 2:12741/149‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTAATGGATCCGTTATTCAGGGTTGTTTATGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGG > 1:1110824/1‑149 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCT > 2:152501/1‑149 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCAGCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGC > 1:240446/1‑149 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGC > 1:1216221/1‑149 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCAGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGTTTGTTTCTGAACTAAATGTCCCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTACAGTCAAGGAACTGC > 1:389397/1‑149 TTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCAC > 1:421206/1‑149 TAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACA < 1:936665/149‑1 AAGTTCCCGCGTATGGGTTGCGTCACAGGCTGCAACTAAACGCGCCTGGAACGGAATGCTATTGGGTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACAC < 2:590143/149‑1 GCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGT < 1:201319/149‑1 GCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGT < 1:607154/149‑1 TTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGT > 1:409186/1‑149 TTATGGGTTGCGGACCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGATCGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCAGCATCCAGCGTCTGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGT < 2:563196/149‑1 GGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGTTGCG > 1:338188/1‑149 GGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGTTGCG < 2:1054040/149‑1 ATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_pgi/2515466‑2515613‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAACGTTTGTTGCG < NC_000913_3_hsa_pgi/4543644‑4543496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |