| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4236253 | 1159 (17.250) | 50 (0.800) | 31/260 | 1.2 | 4.3% | intergenic (+77/‑37) | yjbE/yjbF | extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein/extracellular polysaccharide production lipoprotein |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4236257 | 1167 (18.720) | intergenic (+81/‑33) | yjbE/yjbF | extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein/extracellular polysaccharide production lipoprotein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GGGTGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_pgi/4236095‑4236253‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ataaccacacCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCCG < NC_000913_3_hsa_pgi/4236257‑4236109 GTGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATA > 2:344052/1‑150 TGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAA > 1:638423/1‑150 TGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAA < 1:749709/150‑1 TGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAA < 1:9305/150‑1 TGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGCTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAA < 2:919761/150‑1 GTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC > 1:574638/1‑150 GTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC < 1:654212/150‑1 GTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC < 1:79924/150‑1 GTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC > 2:912615/1‑150 GTCACGCTTGGGGCAACCGGTGTCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGGATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC < 2:1154709/150‑1 TCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACC > 1:198032/1‑150 TCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACC > 1:711841/1‑150 TCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACAATAACC > 2:1019876/1‑150 TCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGAGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACC < 2:199521/150‑1 TCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGAGGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACC > 2:798382/1‑150 TCGCGCTCGCGGCAACCGGAGGCGGTGATGGTTCTAATATCGGGACCACCCCAACAACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCTCCAAAATAATTCGAGTCATTGCCACTGTGGCTAGCAGTATCACGGGATTAACCATAAgc > 2:750691/1‑148 CGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCA < 2:651148/150‑1 CGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCA < 1:308827/150‑1 CGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGGGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCA < 1:189366/150‑1 GCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCAC > 1:362625/1‑150 CGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACA < 2:530642/150‑1 CGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACGACCACAACCACGACCACCGGTACCCAGTTATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGGAGTATGAAGGGATGAACCATAACCGCACagatg > 2:571939/1‑145 ACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGG < 1:651480/150‑1 ACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGG < 1:422069/150‑1 CCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGT < 1:705118/150‑1 CGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACA < 2:873368/137‑1 CGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACA > 1:873368/1‑137 GGTGGCGGCGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACAATAACCACACCGGAGTGTGGTTA > 2:995578/1‑150 gcGGCGGTGATGGTGATATTACCGGGAACACAACAACCACGACCACAAGTACCCCGTAATCAATTATGTATCCACAAAACAATTCGATGCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATACCCACACCGGAGTGTGGTTAT < 2:134268/148‑1 GTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCAGAATCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTAT < 1:30093/150‑1 GTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTAT < 2:711841/150‑1 GTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTAT < 1:343781/150‑1 gGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATG < 1:696139/149‑1 GGCGGGGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGG < 2:372605/150‑1 TTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGT > 1:915780/1‑140 TACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATC < 1:336323/139‑1 CCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATG > 2:420292/1‑121 CCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTAT > 2:718207/1‑120 CCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTAT < 1:393218/114‑1 ACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGG < 2:984211/114‑1 ACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC > 1:10578/1‑93 CAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAAC > 2:34138/1‑85 ctAGTAAAAAAGTATGTTCGACCAAAGTAATGGGAGTAATTGCGTCTGGGGCTAGAATTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAACGCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTG < 2:543367/148‑1 CAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATG < 2:693945/98‑1 ATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTC < 1:1102307/105‑1 ATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTC > 2:1102307/1‑105 TATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATATCCACACCGGAGTGTGGTTATG < 2:1042357/83‑1 TATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATG > 1:1042357/1‑83 TATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAA > 2:65438/1‑62 CCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTG > 1:171642/1‑73 AAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCA > 2:326033/1‑58 AAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCA < 1:326033/58‑1 cCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTT < 1:55382/73‑1 TGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTG < 1:127672/104‑1 TGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTG > 2:127672/1‑104 AGGGATTAACCATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACC > 2:323386/1‑150 ATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGCCTCGAATTAGTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTTGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTACCGGTAGTGGAACCATCACCGCCcc > 2:4585/1‑148 ATAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCGTCATACTACTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTCTTAGAACCATCACAGCCcc > 2:852382/1‑148 TAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACC > 2:788673/1‑150 TAACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTAATGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATCAGAACCATCACCACCACC > 1:655305/1‑150 AACCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCG < 1:1113399/150‑1 AACCACACCCGACTGTGGTAATGGTTAATCCCTTCATTCTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTCTTTTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCG < 1:341308/150‑1 AACAACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCG < 2:768020/150‑1 cccCACCGGAGTTTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGT < 1:48530/147‑1 CCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGT > 1:269712/1‑150 CCACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAA > 1:112653/1‑64 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTATTGGGGTTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTT > 1:392448/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCTTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTT > 2:113500/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCCCCGCCACCGGTT > 1:46852/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTT > 1:1082576/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTT > 1:1176679/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTT > 2:930974/1‑150 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCC < 1:98730/122‑1 CACACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTG > 2:569468/1‑114 CACACCGGAGTGTGGTTAGGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCTCCGCCGGTT > 2:881590/1‑150 tCACCGGAGTGTGGTTATGGTTAAGCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGCTGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCCCCGGTTG > 2:249315/2‑150 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CACCGGAGTGGGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGC < 2:957950/150‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACGGGTTGCC > 2:415903/1‑150 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCC < 1:130834/150‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCC > 2:108966/1‑150 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCC < 2:631023/150‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCC < 2:600921/150‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCC < 1:779535/150‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTGGCC > 1:776662/1‑150 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACAATCACCGCCACCGGTTGCC > 1:728740/1‑150 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTG < 2:301531/114‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGT < 1:533606/104‑1 ACCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGG > 1:833243/1‑90 CCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCCG > 2:808701/1‑150 CCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCCG > 2:1117758/1‑150 CCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTG < 1:162425/98‑1 CCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTG > 2:162425/1‑98 CCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACT > 1:691409/1‑87 GGGTGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAGTATGTATCCCCAAAATAATTCGAGTCATTGCATCTGTGGCTAGAAGTATGAAGGGATTAACCATAACCACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_pgi/4236095‑4236253‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ataaccacacCGGAGTGTGGTTATGGTTAATCCCTTCATACTTCTAGCCACAGATGCAATGACTCGAATTATTTTGGGGATACATACTTTATTACTGGGTACTGGTGGTCGTGGTTGTGGTGGTCCCGGTATTAGAACCATCACCGCCACCGGTTGCCG < NC_000913_3_hsa_pgi/4236257‑4236109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |