| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 3584195 | NA (NA) | 238 (1.810) | 147/268 | 0.0 | 67.4% | intergenic (+15/‑1) | insB1/yrhA | IS1 transposase B/pseudogene, interrupted by IS1E |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 4221464 = | 115 (0.880) | coding (1024/2187 nt) | arpA | ankyrin repeat protein | |||||
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
ATTTATAGCCAAATATAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCA > NC_000913_3_pae_pgi/4221315‑4221613 | gaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccc < 1:173478‑M2/1‑1 (MQ=255) ttATAGCCAAATATAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAg < 3:601414/150‑1 (MQ=255) attgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAg < 2:1002024‑M2/3‑1 (MQ=255) ttgagcggcataccctgaatctgaggcagcacctggcacggccgggacggaagtcgctgtcgttctccaaatcggtggagctgcacgacaaagtcatcgggcattatctgcacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAgg < 4:291518‑M2/4‑1 (MQ=255) ttgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAgg < 3:34947‑M2/4‑1 (MQ=255) gcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGAt > 2:179150‑M2/143‑150 (MQ=255) ccAAATATAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATa > 3:329981/1‑150 (MQ=255) cctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAggg < 1:827856‑M2/17‑1 (MQ=255) aaaCCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAggg > 4:627189/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAggg > 2:903722/1‑150 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGagggt > 2:1226541‑M2/133‑149 (MQ=255) aCCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGt < 4:145078/150‑1 (MQ=255) gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGtt > 1:106662‑M2/131‑150 (MQ=255) tGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTAt > 1:668115/1‑150 (MQ=255) atctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttgtcattatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTAt > 1:342649‑M2/129‑150 (MQ=255) ggTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGTCCAAGTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCAt < 2:175484/150‑1 (MQ=255) ggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATc < 1:1003482‑M2/28‑1 (MQ=255) ggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATc < 1:908994‑M2/28‑1 (MQ=255) gTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATc < 3:260405/150‑1 (MQ=255) gcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATcc > 1:1100164‑M2/122‑150 (MQ=255) agcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCcac < 2:1463207‑M2/31‑1 (MQ=255) aTACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCcaca > 2:140854/1‑150 (MQ=255) gcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCtt < 1:253018‑M2/39‑1 (MQ=255) aGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTTGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTa < 4:691098/150‑1 (MQ=255) ggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGt > 2:771852‑M2/108‑112 (MQ=255) ggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCCCAGAGCCTTTTaa < 4:492919‑M2/43‑1 (MQ=255) ggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTaa < 2:571335‑M2/43‑1 (MQ=255) gctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAAc < 2:876076‑M2/44‑1 (MQ=255) tgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAAcac > 2:1042037‑M2/105‑149 (MQ=255) ggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCa > 2:217430‑M2/103‑150 (MQ=255) cAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCaa < 1:1279795/150‑1 (MQ=255) ggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAg > 3:320758‑M2/99‑150 (MQ=255) aTTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGc > 1:1446869/1‑150 (MQ=255) tttCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCt < 4:388167/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGAATTTGAATTATCAGTTGCTTAAGATGGTGTTTCTGACTAATTGCCATTAGCATATTCATCGTCGCAGGCGATAATGAAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCCGTAGCTg > 4:2086/1‑150 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGtt < 1:592233‑M2/57‑1 (MQ=255) cTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGtt > 2:1488682/1‑150 (MQ=255) gctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTAt < 2:275223‑M2/22‑1 (MQ=255) gctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCt > 1:1076996‑M2/92‑150 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctaaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTc < 1:1342801‑M2/62‑1 (MQ=255) tATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAACAGCTGTTCTTTCg > 4:772583/1‑150 (MQ=255) gttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCaa < 1:288248‑M2/49‑1 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCGTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGaa > 3:818508‑M2/85‑150 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTg < 1:523063‑M2/6‑1 (MQ=255) cTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTg > 3:66282/1‑150 (MQ=255) aaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTg < 1:11636‑M2/72‑1 (MQ=255) tGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTgg > 2:1147389/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTGTTTCGGAAGTGCTGGAatta > 1:531007/1‑150 (MQ=255) tggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAattat > 4:814037‑M2/72‑150 (MQ=255) ttCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAattatt < 3:100989/150‑1 (MQ=255) ttCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCAGCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAattatt < 2:1062282/150‑1 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAattatt < 4:916131‑M2/80‑1 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCaa < 2:47550‑M2/84‑1 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCaa < 4:465998‑M2/84‑1 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCttt > 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> 3:122595‑M2/41‑150 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCAttt > 1:1189860‑M2/41‑150 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCAttt > 2:108715‑M2/41‑150 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGAc < 1:390067‑M2/113‑1 (MQ=255) ataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAgat < 2:860552‑M2/89‑1 (MQ=255) tacaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGCGATCATGGAGGGGTTCTTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCAttt < 1:890904‑M2/118‑1 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCt < 3:924575‑M2/54‑1 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCAttt > 2:936930‑M2/33‑150 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCAttt > 1:1486837‑M2/33‑150 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCAttt > 2:392192‑M2/33‑150 (MQ=255) tGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTc > 2:677100/1‑150 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCag > 2:527256‑M2/30‑150 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCACCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCag > 3:768122‑M2/30‑150 (MQ=255) acactatcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCagg < 1:1371553‑M2/122‑1 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAattat < 2:543569‑M2/79‑1 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTAtt < 1:57113‑M2/23‑1 (MQ=255) aTTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATta < 2:506500/114‑1 (MQ=255) gCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAatta > 3:729707/1‑93 (MQ=255) ttggagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATtaa > 1:457210‑M2/15‑110 (MQ=255) gagtcattaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACAtt < 2:638353‑M2/139‑1 (MQ=255) attaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATtaata < 2:81237‑M2/98‑1 (MQ=255) attaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATaa > 1:236947‑M2/7‑150 (MQ=255) attaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATaa > 3:9078‑M2/7‑150 (MQ=255) ttaccCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATaaa < 4:159368‑M2/145‑1 (MQ=255) cCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATcc > 4:182614‑M2/2‑150 (MQ=255) cAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAgattgat < 4:582703/93‑1 (MQ=255) cAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCa > 4:3413/1‑150 (MQ=255) cAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCa > 2:1421134/1‑150 (MQ=255) | ATTTATAGCCAAATATAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCTGACCAATTGCCATTAGCAAATTCATCGTTGCAGGTGATAATGGAGGGGTTATTTCATCCACAGATCCTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCA > NC_000913_3_pae_pgi/4221315‑4221613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |