New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 4234838 | 1834 (20.900) | 45 (0.550) | 31/272 | 2.6 | 2.5% | intergenic (‑1605/‑328) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
? | NC_000913_3_pae_pgi | = 4234843 | 1828 (22.220) | intergenic (‑1610/‑323) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1991 total aligned reads displayed.
GGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATT > NC_000913_3_pae_pgi/4234694‑4234992 | ggCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTAt > 3:77263/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTACAGGTCGATGGCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACACTTCCGACGTTATg < 4:541896‑M2/150‑2 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATg < 4:346105‑M2/150‑2 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATATCAATGCCGACGTTATgtcg > 4:481640‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcg > 4:316084‑M2/1‑146 (MQ=255) cACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggc < 3:264512‑M2/150‑7 (MQ=255) gccgcATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggcatt < 4:515750‑M2/150‑10 (MQ=255) gccacATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggcatt < 2:298768‑M2/150‑10 (MQ=255) gcATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCAttttt < 1:636743/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTa < 3:210268/150‑1 (MQ=255) cGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATACCCTTAATAGCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATc < 2:40971/150‑1 (MQ=255) cGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggcatttttattaa > 2:748722‑M2/1‑133 (MQ=255) cGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATc > 2:117899/1‑150 (MQ=255) cGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATc < 1:530690/150‑1 (MQ=255) ggCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCAAGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCa > 2:720690/1‑150 (MQ=255) gCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAg < 3:388448/150‑1 (MQ=255) ccGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaa < 4:40100/150‑1 (MQ=255) ccGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaa > 2:360026/1‑150 (MQ=255) cGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaaa > 4:212038/1‑150 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATccc < 3:335049/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATcccc < 1:558441/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCAttttt < 3:45782/132‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCtt < 2:816897/150‑1 (MQ=255) cGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTg < 1:849684/150‑1 (MQ=255) agACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATGTGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTAGGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAACCCCCTTGTCTg < 4:453602/149‑1 (MQ=255) gACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGt > 1:695259/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGt > 3:411484/1‑150 (MQ=255) gcgGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAAt > 2:853509/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTa > 2:426821/1‑150 (MQ=255) tCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTaa > 4:69701/1‑150 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACg > 3:136566/1‑150 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACTATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGaa < 1:252187/150‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGaaa < 1:90007/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACAGGTCGCTGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGGCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAAt < 2:882378/150‑1 (MQ=255) taaaaaaccTACAGGTTGATACCGATATTTACATCGTAT‑TTGGCCATTAATACATAGCTCGATTGATTAAATAACCTTAATACCAATGCCGACTTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATc < 2:578371/143‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATc > 2:387882/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCa > 4:423729/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCa > 1:348063/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt < 2:525471/150‑1 (MQ=255) cAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATa < 1:431179/150‑1 (MQ=255) aGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAACCATAc > 2:276612/1‑150 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAcc < 4:189725/150‑1 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAcc > 3:285780/1‑150 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAcc > 1:307584/1‑150 (MQ=255) gCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTaa < 3:243455/131‑1 (MQ=255) ggTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGtt < 3:510673/150‑1 (MQ=255) tCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATc > 2:474821/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAAt < 3:315242/150‑1 (MQ=255) gtcgaTATGTAGGCCGGATATCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggcattgttattaaggttatttaatcaatcgtgctatgtattaattgccgaatacgatgtacatatcg > 2:128454‑M2/3‑79 (MQ=255) gCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGCAATCATACCGTGAGGTTAATCCTa > 1:449535/1‑150 (MQ=255) gCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTa < 1:765302/150‑1 (MQ=255) cGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTaaa > 1:172578/1‑150 (MQ=255) gTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAt > 4:13588/1‑150 (MQ=255) gTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGACTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAt > 2:606201/1‑150 (MQ=255) aCATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAttt > 2:695022/1‑150 (MQ=255) aCATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAttt < 1:737857/150‑1 (MQ=255) cATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAtttt > 1:871160/1‑150 (MQ=255) gTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAAt < 1:787435/150‑1 (MQ=255) tAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATc < 2:340703/150‑1 (MQ=255) t‑tCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCgt < 2:314411/150‑1 (MQ=255) t‑tCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCgt < 3:360211/150‑1 (MQ=255) tCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCgtt < 1:198070/150‑1 (MQ=255) cGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCgttg > 4:158090/1‑150 (MQ=255) gCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCgttgtt > 2:203851/1‑150 (MQ=255) cAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATAGTTGttt < 2:641881/150‑1 (MQ=255) aTTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGCTAAATCCCCTTGTCCGTAATTTAACAGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCATTGTTTAt > 2:788341/1‑150 (MQ=255) aTTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTAt > 1:477508/1‑150 (MQ=255) tAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTAttt > 1:216305/1‑150 (MQ=255) tACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCgg > 2:15488/1‑150 (MQ=255) aGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATccc > 1:400426/1‑71 (MQ=255) cACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATAc > 3:478102/1‑150 (MQ=255) tgattAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGAt < 2:238208/150‑1 (MQ=255) gattAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGAtt > 1:605140/1‑150 (MQ=255) attAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTa > 2:44742/1‑150 (MQ=255) attAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTa > 4:560836/1‑150 (MQ=255) tAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAAt > 1:81926/1‑150 (MQ=255) aaaTAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGt < 2:553165/89‑1 (MQ=255) aaaTAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAAtt < 1:377645/150‑1 (MQ=255) aaTAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATgtcggcatttttattaaggttatttaatcaatcgtgctatgtattaattgccgaatacgatgtacatatcggcatcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcg < 1:716072‑M2/150‑122 (MQ=255) aaTAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTg > 4:289850/1‑150 (MQ=255) aaCCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCtt > 1:278163/1‑150 (MQ=255) aaCCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCtt > 3:55784/1‑150 (MQ=255) aCCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCttt > 3:437262/1‑150 (MQ=255) ccTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTaa > 1:66273/1‑142 (MQ=255) cTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTg < 3:536454/150‑1 (MQ=255) cTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATAAATTGATTTTg > 3:182765/1‑150 (MQ=255) ttAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGt < 1:508611/150‑1 (MQ=255) taataaCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtt > 4:240846/1‑150 (MQ=255) taataaCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtt > 3:161374/1‑150 (MQ=255) ataaCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt > 2:504900/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaTGCCGACATAACGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt > 3:100751/6‑150 (MQ=255) aaCAATGCCGACGTTATgtcggcattgttattaaggttatttaatcaatcgtgctatgtattaattgccgaatacgatgtacatatcggcatcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgc < 1:585165‑M2/150‑134 (MQ=255) aaCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta < 2:658763/150‑1 (MQ=255) tGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta < 4:264179/150‑1 (MQ=255) ccGACGTTTTGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAATGGATTTCATACCGTGATGTTTATCTTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 1:121397/150‑1 (MQ=255) ccGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 4:107486/150‑1 (MQ=255) cGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 1:100333/1‑150 (MQ=255) cGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 1:1443/1‑150 (MQ=255) cGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 2:169854/1‑150 (MQ=255) aTGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTATTTGTTTTTTATTTCCGAAAATACGCAGATTAATTTCTTTTCTTTTTATTTTAAGTTTATGAt > 4:385548/1‑150 (MQ=255) | GGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTAT‑TCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATT > NC_000913_3_pae_pgi/4234694‑4234992 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |