| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1781359 = | 93 (0.830) | 13 (0.120) | 11/262 | 12.1 | 12.3% | intergenic (+20/‑36) | ydiR/ydiS | putative electron transfer flavoprotein, FAD‑binding subunit/putative oxidoreductase |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1781381 = | 98 (0.930) | intergenic (+42/‑14) | ydiR/ydiS | putative electron transfer flavoprotein, FAD‑binding subunit/putative oxidoreductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCACTGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/1781513‑1781359‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cagcgggaAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAC > NC_000913_3_pae_pgi/1781381‑1781526 GCACTGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAG > 1:505619/1‑150GCACTGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAG < 4:455211/150‑1 ACTGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCG < 1:111252/150‑1 TGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCACGACCAACGTGGCACCGCGACCTGCTCTACCCGCTCCGACCCCAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGG < 1:244563/150‑1 GTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGA < 1:183019/150‑1 GTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGA < 1:183029/150‑1 TATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGG < 2:173252/136‑1 TATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGG > 1:173252/1‑136 CAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGG < 1:303503/130‑1 CAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGG > 2:303503/1‑130 GTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCG < 2:422959/97‑1 GTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCG > 1:422959/1‑97 ACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCACTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCAC > 1:124302/1‑150 AATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGG > 2:203975/1‑150 ATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATCACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATG > 2:1041493/1‑150 CGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTG < 3:686702/107‑1 CGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTG > 4:686702/1‑107 CCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGC > 3:251415/1‑150 CCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGC > 1:1054357/1‑150 CCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCAT > 2:387670/1‑65 CCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCAT < 1:387670/65‑1 CTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCG > 4:384363/1‑150 CCCGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACA > 1:98898/1‑150 CGCTGCGTTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGT > 4:161720/1‑150 TTTACAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAT < 3:161720/150‑1 CAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAA < 1:203975/150‑1 CGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAA < 4:403641/150‑1 GGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAC < 2:1054357/150‑1 AAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG > 2:325121/1‑82 AAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGG < 1:325121/82‑1 GCACTGTCGCCGCGTTCTATCACCAGGACATCCAGCCCGGCTCGTGCCATGACCAGTGCGGCAACGCTACCAGCAACGCCCGCACCGACCACAATGGCATCAAATTTGTCATCCGACATGCGTTATGCTCCCTTCCCGCTGCGTTTACAGCGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_pgi/1781513‑1781359‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cagcgggaAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAC > NC_000913_3_pae_pgi/1781381‑1781526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |