Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_pae_pgi | 2,416,374 | T→G | M543R (ATG→AGG) | pta → | phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_pae_pgi | 2,416,374 | 0 | T | G | 99.5% | 677.6 / ‑4.2 | 188 | M543R (ATG→AGG) | pta | phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (99/88); total (100/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
TGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAC > NC_000913_3_pae_pgi/2416227‑2416519 | gCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCGAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAggctgct > 2:1208842/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAggctgct < 4:604268/150‑1 (MQ=255) cTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAggctg < 2:1557248/147‑1 (MQ=255) cTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAggctg > 1:1557248/1‑147 (MQ=255) aCGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTCATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGaa > 2:1893780/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGgt > 1:1921242/1‑150 (MQ=255) cTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGgtttac < 1:1090973/150‑1 (MQ=255) tGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAggctgct < 3:956938/133‑1 (MQ=255) gAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGgtttacgtt > 2:236380/1‑150 (MQ=255) cAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGgtttacgtttac < 2:748641/150‑1 (MQ=255) aGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGtttacgtttacg < 4:396077/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGt > 1:1776015/1‑148 (MQ=255) gAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGAc > 2:124337/1‑150 (MQ=255) tGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGc > 3:649814/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGa > 1:1577838/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGa < 3:336974/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATc > 2:1507602/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATc < 2:40794/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTTCCGGCGATGTTAACTCACCCGCAAACACCATCGGGCCGCCGCTTCAGCCGATCAAAACTGCACCGGGCAGCGCCCTGGTATCTTCCGTGTGCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGGTTACGTTTACGGTGACTGCGCGATCaa > 4:616101/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGTTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCTGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAAcc < 3:489785/150‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCg > 3:48279/1‑150 (MQ=255) gTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCg > 1:7929/1‑150 (MQ=255) tttCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCgg < 1:483544/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGTTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATcc > 3:673165/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACtgt < 1:1005847/132‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCg > 1:1413870/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCg > 1:674961/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGAc < 1:599098/150‑1 (MQ=255) ttCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAAccc > 1:1007729/1‑136 (MQ=255) ttCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAAccc < 2:1007729/136‑1 (MQ=255) ttCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTg > 1:729695/1‑150 (MQ=255) ttCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTg > 4:144881/1‑150 (MQ=255) tCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGa > 1:433853/1‑150 (MQ=255) cacaCTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGCTCAATTCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGaa < 1:1501477/150‑1 (MQ=255) cacaCTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGgtttacgttt < 1:1307279/112‑1 (MQ=255) cacaCTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGaa < 3:1113738/150‑1 (MQ=255) cacaCTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGaa > 3:754120/1‑150 (MQ=255) tcacTATCGCAATCACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAAc < 2:873617/149‑1 (MQ=255) acTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAg < 2:1715129/150‑1 (MQ=255) acTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCAACGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAg > 2:1306662/1‑150 (MQ=255) tACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCt > 1:1739868/1‑150 (MQ=255) ccGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCCGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCGGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTgg > 2:179299/1‑150 (MQ=255) ccGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTgg < 2:1284501/150‑1 (MQ=255) ccGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTgg > 2:468265/1‑150 (MQ=255) 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cAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAg > 4:698740/1‑150 (MQ=255) aaaCACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGa > 3:530199/1‑150 (MQ=255) ccATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATcg < 2:1921242/150‑1 (MQ=255) ccATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATcg < 2:110109/150‑1 (MQ=255) cATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATcgc < 2:1047873/150‑1 (MQ=255) aTCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACtgt > 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tGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCtt > 2:1829846/1‑150 (MQ=255) tGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCtt > 2:1647578/1‑150 (MQ=255) cACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCg < 1:1208842/150‑1 (MQ=255) aCCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCgg < 1:1647578/150‑1 (MQ=255) ccGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGt < 4:660017/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTa > 2:1577434/1‑150 (MQ=255) gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt < 2:847189/150‑1 (MQ=255) gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt < 2:7929/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCg < 1:385948/150‑1 (MQ=255) cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCgg > 4:215048/1‑141 (MQ=255) cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCgg < 3:215048/141‑1 (MQ=255) tCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcg > 2:929810/1‑150 (MQ=255) ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTATGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGa > 2:1314961/1‑80 (MQ=255) ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTACCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg > 1:1815576/1‑125 (MQ=255) ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTACCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg < 2:1815576/125‑1 (MQ=255) ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGATGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcg > 3:1227343/1‑150 (MQ=255) tGGTATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg > 3:360362/1‑150 (MQ=255) tATCTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg < 1:1893523/150‑1 (MQ=255) cTTCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTa < 1:1834552/150‑1 (MQ=255) ttCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCt > 3:621863/1‑109 (MQ=255) ttCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTAt > 3:1123287/1‑150 (MQ=255) tCCGTGTTCTTGAGGCTGCTGCCGGAAAAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATAGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGCCCTTCGGAAACGAAACGAGAGTTGCCATg > 2:1627942/1‑150 (MQ=255) tCCGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCt > 1:494732/1‑75 (MQ=255) catgtTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGct > 2:1936078/3‑150 (MQ=255) cGTGTTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGct < 4:90491/150‑1 (MQ=255) gtTCTTCAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCTGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCtctc < 2:69876/150‑1 (MQ=255) ttcttcAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTcc < 1:806142/150‑1 (MQ=255) ttcAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc > 3:147394/1‑150 (MQ=255) ttcAGGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc > 1:63176/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAC > NC_000913_3_pae_pgi/2416227‑2416519 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |