| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4,560,739 | C→A | intergenic (‑77/‑173) | yjiH ← / → kptA | nucleoside recognition pore and gate family putative inner membrane transporter/RNA 2'‑phosphotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4,560,739 | 0 | C | A | 93.2% | 363.3 / 18.6 | 117 | intergenic (‑77/‑173) | yjiH/kptA | nucleoside recognition pore and gate family putative inner membrane transporter/RNA 2'‑phosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (58/51); total (62/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATACCCTTTAATGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACATCAGT > NC_000913_3_hsa_tpiA/4560597‑4560877 | aTACCCTTTAATGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTgg < 2:1385430/150‑1 (MQ=255) ttAATGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATggg > 2:1023547/1‑150 (MQ=255) tAATGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgggg < 4:80973/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGa > 1:579369/1‑150 (MQ=255) gCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGaaaa > 4:11553/1‑150 (MQ=255) cccACTTTTTCTTTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCCGGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTCTTTTGTTCCTTAAGCCATGAAGATTCCTGGAACTG‑AAAACCTTGTTAGACATCTGGGTTTGCGCAAAAtt > 2:219900/1‑149 (MQ=255) ccACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACAtgt < 4:963481/134‑1 (MQ=255) ccACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACAtgt > 3:963481/1‑134 (MQ=255) ccACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATg > 4:597954/1‑150 (MQ=255) ccACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATg > 2:769559/1‑150 (MQ=255) ccACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGAAAAATg > 3:999759/1‑150 (MQ=255) aCTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCa > 3:746955/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCaa < 4:516926/150‑1 (MQ=255) tttttCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCGTCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCaa < 3:492346/149‑1 (MQ=255) tttttCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCaa > 4:492346/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGGGCCAGGAAAGTTCCTGGGACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGtttt > 1:1002706/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgggg < 4:487481/132‑1 (MQ=255) tCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgggg > 3:487481/1‑132 (MQ=255) aGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCaa < 2:1258062/136‑1 (MQ=255) aGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCaa > 1:1258062/1‑136 (MQ=255) aGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCt < 3:597954/150‑1 (MQ=255) tCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTACTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTa > 1:1123980/1‑148 (MQ=255) cccGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCg > 1:428441/1‑150 (MQ=255) aGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCa > 3:944666/1‑150 (MQ=255) gCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTg < 2:46444/132‑1 (MQ=255) gCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTg > 1:46444/1‑132 (MQ=255) ccccTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCg < 3:11553/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgg < 1:165182/104‑1 (MQ=255) ccTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgg > 2:165182/1‑104 (MQ=255) ccTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGAAATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTACGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGa > 2:747087/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGaa < 1:1598895/150‑1 (MQ=255) tCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAAtt < 2:609153/146‑1 (MQ=255) tCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAAtt > 1:609153/1‑146 (MQ=255) tCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGc > 1:155619/1‑150 (MQ=255) cATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCt < 4:808474/150‑1 (MQ=255) aTAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATgggg < 2:1589978/94‑1 (MQ=255) aTAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACg < 2:1640668/147‑1 (MQ=255) aTAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACg > 1:1640668/1‑147 (MQ=255) aTAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCtg > 1:763545/1‑150 (MQ=255) aTAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTAGgggg > 1:1589978/1‑94 (MQ=255) tAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCtgt > 3:748183/1‑150 (MQ=255) aaCAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCtgtg < 4:746955/150‑1 (MQ=255) aCAATCCACATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTAATTGAGCAAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTAAAATAAAAAAAAAATTACGCtgtgt < 4:311443/150‑1 (MQ=255) aaTCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGt < 3:890177/83‑1 (MQ=255) aaTCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGt > 4:890177/1‑83 (MQ=255) tcccACTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGAATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGaaa > 1:1327466/2‑150 (MQ=255) cATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGc < 1:328248/119‑1 (MQ=255) cATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGc > 2:328248/1‑119 (MQ=255) cATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAgg > 3:723954/1‑150 (MQ=255) tttttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTg < 2:196218/150‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTgcg > 2:458399/1‑150 (MQ=255) ttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTgcgc > 3:291701/1‑150 (MQ=255) tgtttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATg < 2:1429335/84‑1 (MQ=255) tgtttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATg > 1:1429335/1‑84 (MQ=255) gtttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGAtt < 3:111723/150‑1 (MQ=255) tttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTg > 1:614795/1‑150 (MQ=255) ttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAgg < 3:990687/134‑1 (MQ=255) ttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGctc > 4:12617/1‑137 (MQ=255) ttgtgtGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGctc < 3:12617/137‑1 (MQ=255) gtgtgtTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGt < 2:428441/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTg < 3:820395/150‑1 (MQ=255) gtTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATg > 1:53689/1‑58 (MQ=255) gtTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATg < 2:53689/58‑1 (MQ=255) gtTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCa < 3:830194/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGctct > 1:400734/1‑131 (MQ=255) cTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGaaa > 3:579016/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGaaaa < 4:944666/150‑1 (MQ=255) agttccAGGAATTTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAAt > 4:538512/5‑150 (MQ=255) gAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAAtt > 2:486819/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTc < 2:155619/150‑1 (MQ=255) aGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCa > 3:89876/1‑147 (MQ=255) aGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCa < 4:89876/147‑1 (MQ=255) aGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCAt < 3:166856/148‑1 (MQ=255) aGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCAt > 4:166856/1‑148 (MQ=255) gAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCt < 2:260381/66‑1 (MQ=255) gAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCt > 1:260381/1‑66 (MQ=255) gAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAAc > 2:1074853/1‑150 (MQ=255) gAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAAc > 3:54965/1‑150 (MQ=255) aaaaTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAAcc < 4:638529/150‑1 (MQ=255) aaaTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCtgtgt < 2:418439/104‑1 (MQ=255) aaaTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCtgtgt > 1:418439/1‑104 (MQ=255) aaTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCt > 3:664801/1‑67 (MQ=255) aaTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCt < 4:664801/67‑1 (MQ=255) aTTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAg > 1:1113964/1‑150 (MQ=255) ccTGGAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGa < 4:291701/150‑1 (MQ=255) ggAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACaa < 4:54965/150‑1 (MQ=255) ggAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACaa < 2:763545/150‑1 (MQ=255) ggAACTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACaa > 1:817556/1‑150 (MQ=255) aCTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGa < 2:817556/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAACCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGAc > 4:461194/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACa > 4:219965/1‑142 (MQ=255) aaaaaCCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACa < 3:219965/142‑1 (MQ=255) aaCCTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACATCAGt < 1:486819/150‑1 (MQ=255) aaCCTGATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACATCAGt < 4:834512/150‑1 (MQ=255) ccTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAATTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGa < 2:1073318/135‑1 (MQ=255) ccTTATCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAATTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGa > 1:1073318/1‑135 (MQ=255) cTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAg > 2:1518287/1‑108 (MQ=255) cTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAg < 1:1518287/108‑1 (MQ=255) aTCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACAt < 2:937620/140‑1 (MQ=255) aTCAGACATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGACTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACAt > 1:937620/1‑140 (MQ=255) | ATACCCTTTAATGCCCACTTTTTCTGTCGCCAGCTCCCCGGCTACAGCATCCCCTTGTTGTGTCATAACAATCCCCATTGTTTTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCCATGTGGGTATGGGGAAAATGCAAGTATGTTTCTGGCTATGCGTTTTTTGCATAGCGGAAAAATTACGCTGTGTGGAAAAGGCTCTGCGCAGGATTGAGTTGCAGAAAATTCATAAACCAAGTGACAATGACATCAGT > NC_000913_3_hsa_tpiA/4560597‑4560877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |