Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4,187,572 | G→T | M747I (ATG→ATT) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4,187,572 | 0 | G | T | 98.9% | 331.8 / NA | 91 | M747I (ATG→ATT) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (51/39); total (51/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACC > NC_000913_3_hsa_tpiA/4187428‑4187717 | tAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACATATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CAGATTGCGaa < 3:639891/150‑1 (MQ=255) tAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGaa > 3:757244/1‑150 (MQ=255) gCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCGACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGa > 3:686619/1‑150 (MQ=255) cAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGAt < 2:1209905/150‑1 (MQ=255) cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCt < 2:320074/150‑1 (MQ=255) tGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTc > 1:1043052/1‑150 (MQ=255) gAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTcc < 1:1334884/150‑1 (MQ=255) ccGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCcatca > 2:828888/1‑150 (MQ=255) gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc > 1:1340485/1‑150 (MQ=255) gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc > 1:1157582/1‑150 (MQ=255) gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc < 2:1157582/150‑1 (MQ=255) tAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAc < 3:293085/150‑1 (MQ=255) aGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGa < 1:264322/150‑1 (MQ=255) gAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGCGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGACTCGACAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAAc > 4:124847/1‑150 (MQ=255) gaAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCg < 4:55901/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcgc > 2:243094/1‑140 (MQ=255) aaGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcgc < 1:243094/140‑1 (MQ=255) aaGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 4:367132/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGaa < 1:749545/150‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAg > 2:830325/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGt > 4:452277/1‑150 (MQ=255) ttCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAAc > 2:717853/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGt < 2:159196/150‑1 (MQ=255) aaCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGaa < 1:461562/89‑1 (MQ=255) aaCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGaa > 2:461562/1‑89 (MQ=255) aCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTAc > 3:572433/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACt > 1:518562/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACt < 1:891678/150‑1 (MQ=255) gCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTc < 3:226148/138‑1 (MQ=255) gCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTc > 4:226148/1‑138 (MQ=255) tCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGaa > 3:666398/1‑82 (MQ=255) tCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGaa < 4:666398/82‑1 (MQ=255) aCATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACt > 1:647540/1‑150 (MQ=255) cATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTcc > 2:239976/1‑143 (MQ=255) cATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTcc < 1:239976/143‑1 (MQ=255) cATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACtt < 1:813571/150‑1 (MQ=255) atgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTc > 1:824351/1‑150 (MQ=255) gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACg > 1:1253321/1‑134 (MQ=255) gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACg < 2:1253321/134‑1 (MQ=255) atgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAtc < 2:818558/150‑1 (MQ=255) ggCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAtctc > 1:670513/1‑150 (MQ=255) ccGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTcca > 1:134887/1‑150 (MQ=255) ccGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTcca < 4:151778/150‑1 (MQ=255) ccGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTcca > 3:195250/1‑150 (MQ=255) cGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTccac > 4:98577/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTccacccac > 2:345927/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTcc < 2:522808/142‑1 (MQ=255) cGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTcc > 1:522808/1‑142 (MQ=255) tatGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGt < 3:439153/148‑1 (MQ=255) gTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCGTTCTTTTATGC‑TGGTGCTTATTTCGAGGCCGGAGTGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCTTGATGATCTGAACGTACTCCAGCACTTCATCGCCACCCACGGTg > 2:1356248/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTc > 2:109437/1‑150 (MQ=255) gcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCg < 1:772496/61‑1 (MQ=255) gcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCg > 2:772496/1‑61 (MQ=255) gcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTACATCTCCACCCACGGTGCTCg > 1:694740/1‑150 (MQ=255) gTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTa > 4:569659/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAg > 2:209212/1‑150 (MQ=255) tGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcgc > 1:1176832/1‑84 (MQ=255) tGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcgc < 2:1176832/84‑1 (MQ=255) tGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCt > 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ttCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCg < 3:98577/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCAc < 3:452277/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCAc > 2:229058/1‑150 (MQ=255) tCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACt > 3:540066/1‑150 (MQ=255) gCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGaa > 2:968183/1‑150 (MQ=255) gCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACt < 3:124847/150‑1 (MQ=255) gCTGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACt > 2:1280198/1‑150 (MQ=255) tGGTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGc > 1:114156/1‑150 (MQ=255) tgTATGCGTGGG‑CTGATTGCGAAGCCGGATTGCTCCATCAGCGAAACGCCATTCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCg < 2:336928/149‑1 (MQ=255) gTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCcat < 2:736323/37‑1 (MQ=255) gTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCcat > 1:736323/1‑37 (MQ=255) gTATGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGa > 2:900053/1‑150 (MQ=255) aagCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCAATCATCGAAACACCAATCACCGCGAACTTACGTGACCGTATGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAAc > 2:961121/3‑150 (MQ=255) aTGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTg < 2:1241774/109‑1 (MQ=255) aTGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTg > 1:1241774/1‑109 (MQ=255) tGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCa < 1:671399/47‑1 (MQ=255) tGCGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCa > 2:671399/1‑47 (MQ=255) cGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTc < 1:487473/90‑1 (MQ=255) cGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTc > 2:487473/1‑90 (MQ=255) cGTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTcc > 3:67268/1‑150 (MQ=255) gTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCAc > 3:501431/1‑49 (MQ=255) gTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCAc < 4:501431/49‑1 (MQ=255) gTGGT‑CTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCg > 1:244886/1‑150 (MQ=255) cTGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTAc < 4:435227/150‑1 (MQ=255) tGATTGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTAcc > 1:1333380/1‑150 (MQ=255) | TAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT‑CTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACC > NC_000913_3_hsa_tpiA/4187428‑4187717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |