| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 2295964 | 15 (0.090) | 164 (1.050) | 120/262 | 0.1 | 91.8% | coding (357/738 nt) | ccmC | heme export ABC transporter permease; CcmE‑interacting protein |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2514277 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/2295813‑2295964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/2514277‑2514425 GATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGC < 4:899937/150‑1 CCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAA > 2:1296718/1‑150 CACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAG < 1:1097611/150‑1 ACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGC > 1:548255/1‑150 GCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCC > 2:1702557/1‑142 CAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTA > 2:1613417/1‑150 AATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGTCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAA > 2:834641/1‑150 TCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGC > 1:1266347/1‑135 AGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCC > 4:407814/1‑134 GCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAA < 2:1100563/150‑1 GCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAA < 4:1112950/150‑1 ACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 3:713724/1‑150 GGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:101112/150‑1 GGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 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1:1762193/150‑1 GTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGGTATGATTTAACGTGCCGct > 1:1202255/1‑148 GTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAT > 4:1019663/1‑150 CGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTACGGGTTATGGTTTTACACCTGATAGGATTGAACGTGCCGATGA > 3:783896/1‑150 AAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 4:794825/142‑1 AGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATT > 3:391482/1‑150 GCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 2:1231806/1‑124 CGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:1317299/150‑1 CCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACTCCTGATATTATTTAACGTGCCGATGAATTACGCTCA < 2:1269267/150‑1 CCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCA < 1:1716688/150‑1 ACAGGGCAATCACACCCCTAAACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACG < 1:478156/150‑1 CAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA < 2:17165/150‑1 CAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA > 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CAGGTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCTTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCTCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG < 4:488586/150‑1 GTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCT < 4:783896/150‑1 TGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTC < 1:1613417/150‑1 GCCCATCAGCGCTACCGTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGCTATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCT < 2:1412905/150‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > 3:89605/1‑102 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 3:330853/79‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAC > 1:810602/1‑150 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAC > 2:753330/1‑150 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 1:677832/59‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA > 2:677832/1‑59 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCC > 3:1090925/1‑54 GATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/2295813‑2295964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/2514277‑2514425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |