| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1,774,576 | G→A | G263E (GGG→GAG) | ydiB → | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1,774,576 | 0 | G | A | 91.5% | 646.7 / 34.9 | 213 | G263E (GGG→GAG) | ydiB | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/8); new base A (96/99); total (106/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGTA > NC_000913_3_hsa_tpiA/1774429‑1774722 | tCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCt < 1:547174/150‑1 (MQ=255) cATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTg < 2:1058168/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAATGGTATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa < 4:494063/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa > 1:2568787/1‑150 (MQ=255) tGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAAc > 2:879890/1‑150 (MQ=255) ggTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGGTACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACa > 1:112828/1‑150 (MQ=255) ggTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACa < 2:176627/150‑1 (MQ=255) atatCAGTCTGTTACATCCGGAACTTCTTGTCACTGAATGCGTGTATAACCCAGAGATGACGAAGTTAGTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGAGTGTTGTATACGGCATGTTTTTGTGCCTAGAGGATGAGCAGTTtacct > 4:314890/1‑148 (MQ=255) atCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGATGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTa > 4:1472703/1‑150 (MQ=255) aGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATgg > 1:2046596/1‑150 (MQ=255) gTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGa < 2:2295610/150‑1 (MQ=255) gTCTGTTACACCCGGGACTTTTGGTCACTGAATGCGTGTATCGCCCTCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAGCGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCCAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGa < 2:1554146/150‑1 (MQ=255) tGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTg > 3:130763/1‑150 (MQ=255) aCATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCaa < 1:688261/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCaaa < 2:1825066/149‑1 (MQ=255) tCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCCGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGa > 2:1088409/1‑150 (MQ=255) ggACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTc < 3:756785/150‑1 (MQ=255) gACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTcc < 3:599668/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGGTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCctc > 4:811435/1‑150 (MQ=255) ttCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCctc > 3:1534527/1‑150 (MQ=255) cTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 2:1144605/1‑150 (MQ=255) cTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGATTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 4:1411674/1‑150 (MQ=255) tGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAgggg < 2:668725/108‑1 (MQ=255) tCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 1:1489467/1‑146 (MQ=255) tCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAat > 1:1269302/1‑150 (MQ=255) aCTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCt > 3:1236558/1‑105 (MQ=255) aCTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCt < 4:1236558/105‑1 (MQ=255) aCTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAatat > 3:171775/1‑150 (MQ=255) tGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa > 1:1055485/1‑106 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTaaa > 2:587268/1‑150 (MQ=255) gCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAAc > 2:2357111/1‑150 (MQ=255) gtgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAAc < 1:1160664/148‑1 (MQ=255) gtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGt > 2:2168477/1‑150 (MQ=255) tataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGa > 2:1221985/1‑112 (MQ=255) tataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTcc < 1:1140902/127‑1 (MQ=255) taACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCAt > 1:1179505/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 2:940102/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 3:1398808/150‑1 (MQ=255) ccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATgggg > 3:463953/1‑150 (MQ=255) ccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATgggg < 1:587268/150‑1 (MQ=255) cGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGt < 3:820284/150‑1 (MQ=255) atGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGt < 4:130763/150‑1 (MQ=255) gACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCATCTGGAATATGTTAAAACGGTCATGGGGTTCGGTGc > 4:302280/1‑150 (MQ=255) gTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACa > 2:1160849/1‑150 (MQ=255) gTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACa > 2:1807966/1‑150 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTg < 1:864540/72‑1 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAgg < 2:2568787/150‑1 (MQ=255) aTTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTTTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGc < 3:501973/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt > 3:577205/1‑116 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt < 4:577205/116‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCt < 1:1627835/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCt > 3:287530/1‑150 (MQ=255) cagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACcgc < 2:503935/150‑1 (MQ=255) gcgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 3:312589/1‑99 (MQ=255) cgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGAc > 1:2349311/1‑135 (MQ=255) cgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTAAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGc < 2:334514/150‑1 (MQ=255) caacaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTg < 1:935472/79‑1 (MQ=255) aacaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTaaa > 4:1123864/1‑107 (MQ=255) aacaaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTaaa < 3:1123864/107‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAg > 4:40602/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAACCAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAgg < 1:2015052/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACa < 3:353515/129‑1 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaa > 4:730570/1‑150 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaa > 2:1975732/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaa > 3:970831/1‑150 (MQ=255) gCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaaa > 2:1667327/1‑150 (MQ=255) gCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaaa > 4:1087872/1‑150 (MQ=255) gCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGACAAAGATTGCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaaa < 2:2384812/150‑1 (MQ=255) cAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACAtt > 1:2535324/1‑57 (MQ=255) cAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAAt < 2:1508178/150‑1 (MQ=255) cAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTCCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAAt < 2:2531326/150‑1 (MQ=255) aTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa < 1:1220717/150‑1 (MQ=255) aTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa < 4:883781/150‑1 (MQ=255) aTACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGt > 2:465763/1‑150 (MQ=255) aCGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt > 3:1422176/1‑73 (MQ=255) ggCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGAc > 1:1830683/1‑100 (MQ=255) ggCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTaaaa > 4:1045026/1‑150 (MQ=255) ggCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTaaaa > 2:482552/1‑150 (MQ=255) gCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCctc < 2:2072669/60‑1 (MQ=255) gCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCctc > 1:2072669/1‑60 (MQ=255) gCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa > 1:34020/1‑141 (MQ=255) tgttgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 1:2117430/80‑1 (MQ=255) tgttgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGAtc < 1:1667327/150‑1 (MQ=255) tgttgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGAtc > 1:2393159/1‑150 (MQ=255) gttgttgtGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaaa > 2:1604833/1‑125 (MQ=255) tgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt < 1:1586499/64‑1 (MQ=255) tgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt > 2:1586499/1‑64 (MQ=255) gttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGt < 2:1709497/150‑1 (MQ=255) ttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTcc < 4:1391999/49‑1 (MQ=255) ttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTc < 1:1546570/150‑1 (MQ=255) tgtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAgg < 1:415146/93‑1 (MQ=255) tgtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAgg > 2:415146/1‑93 (MQ=255) gtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACcgcg > 2:1137687/1‑101 (MQ=255) gtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAt > 1:821420/1‑150 (MQ=255) gtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAt > 4:612204/1‑150 (MQ=255) gtgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAt > 2:1832863/1‑150 (MQ=255) tgGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt < 1:1595236/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGTGCTCGTCATTg < 2:402746/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTg < 1:171726/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTg > 2:1400261/1‑150 (MQ=255) | AATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGTA > NC_000913_3_hsa_tpiA/1774429‑1774722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |