New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 59296 | 197 (0.890) | 24 (0.120) | 19/244 | 19.1 | 12.4% | intergenic (+17/+391) | yabP/rluA | pseudogene, pentapeptide repeats‑containing/dual specificity 23S rRNA pseudouridine(746), tRNA pseudouridine(32) synthase, SAM‑dependent |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 59302 | 167 (0.860) | intergenic (+23/+385) | yabP/rluA | pseudogene, pentapeptide repeats‑containing/dual specificity 23S rRNA pseudouridine(746), tRNA pseudouridine(32) synthase, SAM‑dependent | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/59131‑59296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctaaggttgaaggggcGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAA < NC_000913_3_hsa_tpiA/59302‑59155 CTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCACAAAAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAG < 4:83920/150‑1 CTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAAACCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAG < 2:678644/150‑1 TACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGC < 3:90099/150‑1 TACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGC > 4:197741/1‑150 TACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGC > 4:800685/1‑150 ACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCT > 2:1254909/1‑150 ACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCT > 3:1617779/1‑150 TTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTT > 4:847582/1‑150 TTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTT > 1:1818317/1‑150 ATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGA > 1:1577496/1‑150 TATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAA > 1:177664/1‑150 TGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGGATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGG > 1:1898176/1‑150 TGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGG > 4:1635736/1‑150 GATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGG > 3:1456802/1‑150 GATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGG > 2:523745/1‑150 GATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGG > 3:1455399/1‑150 GATGAGGTAATTATTATTAATAAAAGCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGATGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGG > 3:481216/1‑150 GTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAG < 1:382235/135‑1 GTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAG > 2:382235/1‑135 AATTATTATCAATAAAATCCCCATCAAAAAAATTGATAGTTATGGAGTTGCTACTGAAGAAGTGGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAGCGCAATGATTGAGTGAGCCAGAATCAGCTAAGGTTGGAGGGGgtcggac < 2:1069945/150‑8 TTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGC < 4:81908/150‑1 TTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCC < 1:286447/150‑1 TTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTC < 3:576808/150‑1 TAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCA < 1:2168478/150‑1 TAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCA < 3:611616/150‑1 ATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAGTTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAAC < 3:1364606/150‑1 AATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTA < 2:229429/150‑1 CCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTT < 1:998116/150‑1 AAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGTCGTTCCAGCCCC < 4:1404009/129‑1 AAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCC > 3:1404009/1‑129 AAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGC < 2:2197036/150‑1 AAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGC < 4:794446/150‑1 CTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAA < 2:683418/150‑1 TAAAGGGGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCT < 3:268327/117‑1 TAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCT > 4:268327/1‑117 AAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTT < 1:1586849/150‑1 AAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTT < 4:299650/150‑1 TAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATCCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACT > 2:1898176/1‑150 AAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGC > 2:256887/1‑73 AAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGC < 1:256887/73‑1 AAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCA > 2:1308590/1‑87 AAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCA < 1:1308590/87‑1 GCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTA < 1:145423/115‑1 GCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTA > 2:145423/1‑115 GCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTT > 4:974456/1‑93 GCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTT < 3:974456/93‑1 GCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGA < 1:951375/150‑1 CTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAGTTTTTTTGGGGGGGAT > 4:1455399/1‑150 CTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAGTTTTTTTGGGGGGGAT > 4:1456802/1‑150 CTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGAT < 3:407963/150‑1 AGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTT < 3:1170400/150‑1 AGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTT < 1:1500667/150‑1 GGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTA < 4:670425/150‑1 GGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTA < 1:563960/150‑1 GTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTAT > 3:477665/1‑150 GTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTAT < 2:1106777/150‑1 GTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTAT > 2:429741/1‑150 TTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTTATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGTGGGGGTTTTTATT > 2:2269044/1‑150 TTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATT > 1:2384740/1‑150 TTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATT > 1:409453/1‑150 TGAAGGGGCGTTCCAGCTCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCGCATTCAATAATTGCGGTGTCAGTAATTTGTTGAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCACCTCCTTTCGTATCAATATTTTTGGGGGGGATTTTATTA > 4:1067478/1‑150 TGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGTTTTTATTA > 3:1123002/1‑150 TGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCATTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTA > 3:1312572/1‑150 GAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAA < 1:429741/150‑1 GAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGAGTTTATTAA > 4:481216/1‑150 AAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAAT > 2:1673294/1‑150 AGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATA < 1:1488364/150‑1 GGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGACTCATTCAATAAT < 1:268412/50‑1 GGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGACTCATTCAATAAT > 2:268412/1‑50 GGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATACAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAAT > 4:217711/1‑150 GCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGTTTTTATTAATAATAA > 4:1285722/1‑150 GCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAA < 2:715634/150‑1 CTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/59131‑59296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctaaggttgaaggggcGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAA < NC_000913_3_hsa_tpiA/59302‑59155 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |