| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3437896 = | 117 (1.290) | 10 (0.120) | 10/246 | 9.0 | 8.5% | intergenic (+2/‑128) | trkA/mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel protein, high conductance |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3437924 = | 109 (1.320) | intergenic (+30/‑100) | trkA/mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel protein, high conductance | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_tpiA/3438056‑3437896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacgccttattaTTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/3437924‑3438068 CGCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAG > 2:663500/1‑150CGCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAG > 3:414361/1‑150 GCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGA < 3:317233/150‑1 GCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGA < 3:180679/150‑1 CGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGGCGCCTTA < 2:940408/150‑1 TAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTT > 1:77482/1‑149 TAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTT < 2:77482/149‑1 TCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCT > 3:75117/1‑150 GCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGAC > 1:405785/1‑150 GAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATA > 3:388712/1‑150 TGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAG > 3:304418/1‑150 AAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATT < 1:968612/145‑1 AAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATT > 2:968612/1‑145 TAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCG > 4:209254/1‑150 AAGGCGTCATTAGACGCCTTATTAATTCCCTTTGATCATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGA > 2:968387/1‑150 ACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGC < 1:180921/150‑1 CGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCG > 2:877068/1‑150 GCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGG > 1:196317/1‑150 GCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGG < 4:304418/150‑1 CTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGA > 1:900535/1‑150 TTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGT > 4:331429/1‑85 TTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGT < 3:331429/85‑1 TATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAAC > 1:173377/1‑150 TATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAAC > 1:101750/1‑150 TATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGG < 2:214935/96‑1 TATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGG > 1:214935/1‑96 ATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTAT < 2:550952/77‑1 ATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTAT > 1:550952/1‑77 CGCAAATTCGCGAAATTCTTTAATAATGCTCATGTTATTCTCCCTATGAAGCCGACAACCATAAGTCTAACAAATGTTAAGCCATTTTCCTGCCAGGAATGAATTTAATTAATCCTTGATAATCAAAGGGAAATAATAAGGCGTCATTAGACGCCTTATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_tpiA/3438056‑3437896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacgccttattaTTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/3437924‑3438068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |