Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1978503 | 1979278 | 776 | 108 [0] | [0] 108 | insB1–insA | insB1,insA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 1978502 | 0 (0.000) | 102 (1.200) | 79/254 | 0.1 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCT > NC_000913_3_hsa_tpiA/1978356‑1978645 | gAAATGGGTCTTTACACTTATCTAGGTTTTTTCCTATATTGTCGCAACTTTAGTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATGTTTTATAATGCTTGATGCAGATCACACTAAACACTCTATTACTTAACATAAATGtat > 2:408583‑M1/1‑147 (MQ=255) aTGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataag > 4:540674‑M1/1‑144 (MQ=255) tgagtctGTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAGTCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt < 4:457897‑M1/147‑8 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |