| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2,755,548 | C→T | 6.3% | intergenic (+170/‑611) | smpB → / → intA | tmRNA‑binding trans‑translation protein/CP4‑57 prophage; integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2,755,548 | 0 | C | T | 6.3% | 202.0 / 4.0 | 64 | intergenic (+170/‑611) | smpB/intA | tmRNA‑binding trans‑translation protein/CP4‑57 prophage; integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/31); new base T (2/2); total (31/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.26e-01 | |||||||||||
CCAGTTCCTCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAACGACGAAAA > NC_000913_3_hsa_tpiA/2755399‑2755695 | ccAGTTCCTCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGc > 3:119688/1‑150 (MQ=255) ttCCTCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGt > 3:273847/1‑150 (MQ=255) tCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTCTTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATg > 2:199123/1‑150 (MQ=255) tCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGATTAAAAAAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATg < 4:237660/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGgcg > 1:79402/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGgcg > 1:44548/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCGAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGgcg < 3:200168/150‑1 (MQ=255) ctcccttTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATa < 1:307792/150‑1 (MQ=255) tctcCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCt > 1:180629/1‑150 (MQ=255) ctcCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTg < 1:192172/150‑1 (MQ=255) gcggcgCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGtata > 4:34575/1‑150 (MQ=255) gcggcgCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGACATGGCGCTCATAAATCTGGtata > 1:268802/1‑150 (MQ=255) cgAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGTTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTAcc > 2:111179/1‑150 (MQ=255) cgAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGTTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTAcc > 2:111185/1‑150 (MQ=255) gAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGGTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCt < 3:72234/150‑1 (MQ=255) attaaCATCTTATTTGCTATCACATCCTACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACTATAACGCCAGTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCttt < 4:148660/147‑1 (MQ=255) gAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTac > 1:237855/1‑150 (MQ=255) gAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTac > 2:180380/1‑150 (MQ=255) aTCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACAt > 3:142050/1‑150 (MQ=255) tGGCTATAACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTCATCGAAGAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACCCCATTGAGCCGGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTCCCTTTACACATTGGGGCt > 2:174273/1‑150 (MQ=255) aTCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTc < 2:249348/150‑1 (MQ=255) tCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCt < 1:554360/150‑1 (MQ=255) caTCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGa < 3:251740/150‑1 (MQ=255) caTCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGa < 2:446186/150‑1 (MQ=255) caTCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGa < 2:480503/150‑1 (MQ=255) aTCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGAt > 4:1286/1‑150 (MQ=255) aTCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCATTAACGATAACGCCAAAGAGGCTTGTCAGGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACAGTGGGGCTGATTCTGGAt > 1:24018/1‑150 (MQ=255) cGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCg > 1:330575/1‑150 (MQ=255) gACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGa > 2:521898/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGa < 2:79402/150‑1 (MQ=255) tGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCg < 2:289479/150‑1 (MQ=255) tGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTAACTGGGTGCTAAATCTTTCACAATAACGCCATTGAAGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCg < 3:129702/150‑1 (MQ=255) gCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGa > 3:307877/1‑150 (MQ=255) tCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAAcc > 2:402831/1‑150 (MQ=255) tCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTATAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAAcc > 2:388257/1‑150 (MQ=255) ccATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCa > 3:284957/1‑150 (MQ=255) cATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCaa < 1:19402/150‑1 (MQ=255) ttGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGCAAGCCaatt > 3:371788/1‑148 (MQ=255) gCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTg > 1:149253/1‑150 (MQ=255) cTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACCTGGGTGCTACATCTTAAACGATAACGCCATCGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTTCCTTTACAGATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGc > 2:167921/1‑150 (MQ=255) cTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGc < 4:42547/150‑1 (MQ=255) aaTCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATg < 4:169677/150‑1 (MQ=255) tCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGcc > 3:194751/1‑150 (MQ=255) tacaaaTCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAggg < 2:24018/147‑1 (MQ=255) aaaaaTCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAgggg > 3:56626/1‑150 (MQ=255) gaaaTGGGTGCTAAATGTTTAACGATACCGCCATTGAGGCTGGTTATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCGTTACACATGGGGGCTGATTCTGGATTAGACGGGGTCTGCGAATCTCATGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTc < 2:70020/147‑1 (MQ=255) ggTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTaaaa < 4:31398/150‑1 (MQ=255) ggTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTaaaa < 4:278301/150‑1 (MQ=255) ggTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTaaaa < 4:278287/150‑1 (MQ=255) cTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGcc < 2:229227/150‑1 (MQ=255) tAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCg < 2:180629/150‑1 (MQ=255) aaTCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGATGCATGCCGCGGGGCGGTTGGCCGCGTAGAAAGCCGCa > 3:203918/1‑150 (MQ=255) cTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGCCGCGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATTCCGAGGGGCCTTTGGCCTCGTAAAAAACCGCaaaa < 4:114398/150‑1 (MQ=255) ttAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCaaaaaa < 1:28406/150‑1 (MQ=255) ttAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCaaaaaa < 1:22800/150‑1 (MQ=255) ttAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCaaaaaa < 4:284957/150‑1 (MQ=255) aaCGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTGGCGAAAACCAAAGTGAATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAGAATa < 2:330575/150‑1 (MQ=255) aCGATAACGCCATTGAGGTTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAg < 1:111185/150‑1 (MQ=255) aCGATAACGCCATTGAGGTTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAg < 1:111179/150‑1 (MQ=255) aCGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAg > 3:243849/1‑150 (MQ=255) cGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACGCATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCaaa < 3:34575/150‑1 (MQ=255) gCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAac > 2:319651/1‑150 (MQ=255) gCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAac > 3:211662/1‑150 (MQ=255) ttGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAacgacg > 3:37013/1‑150 (MQ=255) gAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAACGACGaa < 1:113181/150‑1 (MQ=255) cccTGGTCATGGCGCTCATACATCTGGTATATTTACCTTTACACATTCGGGCTGACTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGGGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAACGACGaaca < 4:22879/148‑3 (MQ=255) | CCAGTTCCTCACCGCGCCTCCCTCTCCGGCGGCGCGAATGAACATCTTATTGGCTATCACATCCGACACAAATGTTGCCATCCCATTGCTTAATCGAATAAAAATCAGGCTACATGGGTGCTAAATCTTTAACGATAACGCCATTGAGGCTGGTCATGGCGCTCATAAATCTGGTATACTTACCTTTACACATTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAATAGTCGCAAACGACGAAAA > NC_000913_3_hsa_tpiA/2755399‑2755695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |