| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 389,925 | (T)6→7 | intergenic (‑198/‑326) | hemB ← / → yaiT | 5‑aminolevulinate dehydratase (porphobilinogen synthase)/pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 389,919 | 1 | . | T | 92.6% | 407.7 / 25.4 | 121 | intergenic (‑192/‑332) | hemB/yaiT | 5‑aminolevulinate dehydratase (porphobilinogen synthase)/pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/6); new base T (65/47); total (68/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GAAGCAGGGTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTGAAATACT > NC_000913_3_hsa_tpiA/389770‑390063 | gAAGCAGGGTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGttatta > 2:214817/1‑150 (MQ=255) aGGGTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑t‑tttt > 1:23917/1‑150 (MQ=255) gggTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑t‑ttttt < 2:24598/150‑1 (MQ=255) ggTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑t‑tttttt > 3:779091/1‑149 (MQ=255) gATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGtt > 3:104943/1‑150 (MQ=255) gATGTTTGACGAAAGTTGTTGCGATATTGATAAGAAGAGAATGTAAGAGAGGCCAGAACATCTTTTTAATAGATACAAAAATAATTTTGTATTCAGTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGCTTATTA‑TCTTTTT‑CGAGtt < 4:161948/150‑1 (MQ=255) ggggtgaCGAAAGTGGTCGGGATGTTGACAAGAAGAGAAGGGAAGAGGGGCCAGGAGATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTgg < 2:985150/144‑1 (MQ=255) ttttACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGt > 2:81742/1‑150 (MQ=255) ttACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTg < 2:1069085/150‑1 (MQ=255) aCGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTgcg > 2:1141202/1‑150 (MQ=255) gAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTTCgct > 1:318221/1‑150 (MQ=255) aaaGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCgctg > 1:802938/1‑150 (MQ=255) aaGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCgctgc < 4:587527/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCta > 2:460711/1‑150 (MQ=255) tCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATaaa > 2:79017/1‑150 (MQ=255) cgATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTg < 1:570804/150‑1 (MQ=255) gATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGa < 3:209915/150‑1 (MQ=255) aTGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGaa < 3:23470/150‑1 (MQ=255) aTGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGaa < 2:1092800/150‑1 (MQ=255) aCAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTa > 1:892667/1‑150 (MQ=255) aagaagAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTaaa > 3:387384/1‑150 (MQ=255) aagaagAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTaaa > 2:125827/1‑150 (MQ=255) gaagaGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAAc < 2:802938/150‑1 (MQ=255) gagaATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACttt < 2:892667/150‑1 (MQ=255) agaATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCCCTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGATATAAATTGAATAATTAAAACTttg > 2:1019830/1‑150 (MQ=255) aaTGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTttgtt < 4:486596/150‑1 (MQ=255) aaTGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTttgtt > 1:932321/1‑150 (MQ=255) aTGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTttgttg > 2:59952/1‑150 (MQ=255) ggAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCa > 3:479331/1‑150 (MQ=255) gAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTTTTTTTTTTTTACAACAGCAGTTAATTA‑T‑TTTTTAGGCGTTTGGTCGCTCTAGTCTAAATCGAATAATTTCACCTTCGTTGCat > 2:440780/1‑150 (MQ=255) gAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCat > 3:193059/1‑150 (MQ=255) aaGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑t‑tttttt > 3:508616/1‑99 (MQ=255) aaGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑t‑tttttt < 4:508616/100‑2 (MQ=255) gagagGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACttt < 1:226866/140‑1 (MQ=255) gagagGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACttt > 2:226866/1‑140 (MQ=255) gCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAg < 4:779091/150‑1 (MQ=255) gCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAg > 3:483607/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAATTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTAt < 3:221519/150‑1 (MQ=255) aTCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGATGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCTATGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTAATAGGATAtttt > 4:712042/1‑149 (MQ=255) tCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTAt > 4:262333/1‑150 (MQ=255) ttttAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTg > 1:759709/1‑150 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgttt < 3:429411/150‑1 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgt < 2:908531/150‑1 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgt > 1:750670/1‑150 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgtg < 1:179014/150‑1 (MQ=255) aGAAACAGCAATATTTTTCTATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGATTTTGTTTTCTCTGCTATAAATTTAATATTTAAAATTTTTTTGCATCTTTATAGGATATTTTTCTGgtttgtg > 4:507879/1‑150 (MQ=255) aGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgtg > 1:258850/1‑150 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgtgttt < 2:940542/150‑1 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGTAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgtgtttgt < 4:106725/150‑1 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgtgtttgt < 1:125827/150‑1 (MQ=255) gCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTTTGa > 4:736592/1‑150 (MQ=255) cAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGat > 1:15898/1‑150 (MQ=255) cAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGat > 2:125799/1‑150 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGTTTTGTGTTTGTGatt > 4:328006/1‑149 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGata > 2:225672/1‑150 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTGGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTTGTTGCGCTGCTAGAAATTGAATAATTAAAACTTTGGTGCATATGCATAGGAGATTTATTGGGTTTGTGTTTGTGatt > 1:319020/1‑149 (MQ=255) ttttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGAtatttat > 4:433567/1‑150 (MQ=255) ttttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGAtatttat < 4:390017/150‑1 (MQ=255) ttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTGATAGCTGTTGGTAATTATT‑TTTTT‑GTGGTTTGGTTGCGCTGCTATTAATTGAATAATTAAAGCTTTGTTGCATATTCATATGATATTTGTCTGGTTTGTGGTTGTAATATttatta > 4:117371/1‑150 (MQ=255) tataTTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTtattat < 1:1171187/150‑1 (MQ=255) atatTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATg < 2:750670/150‑1 (MQ=255) tCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑TTTTTTTTGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATTCGtt > 4:61386/1‑149 (MQ=255) tCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTa > 1:219404/1‑150 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATg < 4:483607/150‑1 (MQ=255) tGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTTTTTTTTGTTTGTGATATTTTTtattcttattct > 4:598949/1‑150 (MQ=255) tGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GTTTTTTGTTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATTCt > 4:150455/1‑150 (MQ=255) gAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGTGTTTGGTTGTGCTGCTAAAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATACGTTGTTTATCTGGTTTGTGTTTGTGTTATTTATTATACGTATGAtt > 4:696377/1‑150 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTc < 1:65916/150‑1 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTc > 2:815391/1‑150 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCa < 1:1010007/150‑1 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCaa > 1:1077736/1‑150 (MQ=255) atTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCaaaaa < 3:194722/150‑1 (MQ=255) atTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATCAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCaaaaa > 3:332506/1‑150 (MQ=255) tttttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAAc < 3:504166/150‑1 (MQ=255) ttttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACa > 4:19264/1‑150 (MQ=255) ttgtAATCTTTATTTATTGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTATGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACa < 4:558943/147‑1 (MQ=255) tttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACaa < 3:393884/150‑1 (MQ=255) tttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTaaaaaaaaaa < 4:303338/150‑1 (MQ=255) ttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgt < 1:371800/112‑1 (MQ=255) ttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGgtttgt > 2:371800/1‑112 (MQ=255) ttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACaaa < 4:466108/150‑1 (MQ=255) ttAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACaaa < 2:458477/150‑1 (MQ=255) cTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGAtattt > 1:1221604/1‑120 (MQ=255) cTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGAtattt < 2:1221604/120‑1 (MQ=255) cTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTAt > 3:663222/1‑150 (MQ=255) cTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTAt < 3:19264/150‑1 (MQ=255) tttatttaTAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATc > 1:325633/1‑150 (MQ=255) ttatttatAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCt > 4:323339/1‑150 (MQ=255) ttatttatAGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCt > 1:77962/1‑150 (MQ=255) ttatAGCTGTTGGTCATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCaa < 1:242266/150‑1 (MQ=255) aGCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATg < 3:580615/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGt < 3:193178/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑TGTTTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGtt > 2:243709/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAATCTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAATAACGAAATTATCTGCAACATGtt < 4:772460/150‑1 (MQ=255) tGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTg < 2:77962/150‑1 (MQ=255) tGTTGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTCGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGAATATTCATAGGGTATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTg < 4:196771/150‑1 (MQ=255) ttGGTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGAAAAAAAAAAAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTGaa < 2:915899/150‑1 (MQ=255) gTTATTATT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTGAAATa > 1:572471/1‑150 (MQ=255) ttattatT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCCGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATTTGGTTGGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGGTGAAATAc > 4:775361/1‑150 (MQ=255) tattatT‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTGAAATACt < 1:225672/150‑1 (MQ=255) | GAAGCAGGGTAGGGATGTTTTACGAAAGTTGTCGCGATGTTGACAAGAAGAGAATGGAAGAGAGGCCAGGACATCTTTTTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTA‑T‑TTTTT‑GGAGTTTGGTTGCGCTGCTATAAATTGAATAATTAAAACTTTGTTGCATATTCATAGGATATTTATCTGGTTTGTGTTTGTGATATTTATTATGCGTATGCTTCAAAAACAAAATTATCTGCAACATGTTGAAATACT > NC_000913_3_hsa_tpiA/389770‑390063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |