| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 987,978 | A→G | D336D (GAT→GAC) | asnS ← | asparaginyl tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 987,978 | 0 | A | G | 93.2% | 317.9 / 8.2 | 103 | D336D (GAT→GAC) | asnS | asparaginyl tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/3); new base G (50/46); total (54/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCGCAAAATCGGCTTCAATGAAGCGTTCCAGACGTGAAACGGCATCTTTATCTACGCGTTCAGCGA > NC_000913_3_hsa_tpiA/987831‑988123 | cGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGGTc < 1:256658/150‑1 (MQ=255) ggAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGGTCg > 2:969959/1‑150 (MQ=255) ggAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGGTCg > 1:466171/1‑150 (MQ=255) 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agaagaGAGGTCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCGCAAAATCGGCTTCAATGAAGCGTTCCAGACGTGAAACGGCATCTTTATCTACGCGTTc > 1:226493/1‑150 (MQ=255) agaagaGAGGTCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCGCAAAATCGGCTTCAATGAAGCGTTCCAGACGTGAAACGGCATCTTTATCTACGCGTTc > 4:656484/1‑150 (MQ=255) agaggTCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCGCAAAATCGGATTCAATGAAGCGTTCCAGACGTGAAACGGCATCTTTATCTACGCGTTCAGCga > 2:732736/1‑150 (MQ=255) | CGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCGCAAAATCGGCTTCAATGAAGCGTTCCAGACGTGAAACGGCATCTTTATCTACGCGTTCAGCGA > NC_000913_3_hsa_tpiA/987831‑988123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |