| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2470479 | 179 (1.570) | 13 (0.120) | 11/278 | 9.2 | 7.3% | intergenic (+17/‑336) | gtrS/tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related |
| ? | NC_000913 | = 2470483 | 160 (1.490) | intergenic (+21/‑332) | gtrS/tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2470323‑2470479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcgcgccaTGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCTA < NC_000913/2470483‑2470336 TCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATTAAATAATTCAAAGAAATAAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATT > 1:210029/1‑149TCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATATCGATGTAAAGAAATAATTTTAAATT > 1:1749701/1‑149 GGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGC > 1:107383/1‑149 GGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGC < 2:137922/149‑1 GGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCATATACAAAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAATAAAACAAGACAATAGCAATTTAAAGCACTATGTTTAAATTtcc > 2:1200479/1‑146 GGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGC < 1:529219/149‑1 GAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCG > 2:1849014/1‑149 AAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGC < 2:786326/149‑1 AAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGC > 1:1622278/1‑149 ATTTCAGCAAGCATGTATTGGGAATGGATTTTTCGTTCGAGCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATTAAATCATTCAAAGAAAGCACGCCAATAGCGAGGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGC < 1:1349678/149‑1 ATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGC < 1:770064/149‑1 TTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCG < 1:642380/149‑1 TTAATCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGC < 1:780082/149‑1 AAGCAAGCTTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTTTAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGTTGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAA < 1:1616720/149‑1 AAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAA < 1:521290/149‑1 GCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAA < 1:1008601/149‑1 CATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGAACTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAAC < 2:1145913/149‑1 TGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCT > 2:33630/1‑149 GTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGT < 1:33630/149‑1 CTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATCTAAAGCACTACGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTT < 1:1361734/149‑1 ATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAA < 2:523676/149‑1 ATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAAGTGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAAC < 2:475339/149‑1 TGCGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTA > 1:1859640/1‑149 CGCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAA < 2:400472/149‑1 GCGCGATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTTAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGGCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAAT < 1:1017419/149‑1 GCGCCATGATTGGCGCGCAATTTACACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAAT < 2:620121/149‑1 GCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAAT > 1:888995/1‑149 GCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAAT > 2:169618/1‑149 GCGCCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAAT < 1:606966/149‑1 cgATGTTTGGCGCGCAATTTAAACTAATTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAACGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTC < 2:1065082/147‑1 CCATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTC < 2:743543/149‑1 CATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAATCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTACAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCT > 1:37255/1‑149 CATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCT < 1:1802591/149‑1 CATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGAATGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACTAAAAATACATTCCAAATAAATGATTGCTTAAATCTCT > 1:1770852/1‑149 ATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCTA < 2:431662/149‑1 ATGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCTA < 1:587772/149‑1 TCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2470323‑2470479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcgcgccaTGATTGGCGCGCAATTTAAACTTAGTGCTTTACATCGCTATTGTCTTGATTTCTTTGAATTATTTTATAAATTAAAAAAACGACTGTTATGTATAAGCAAAGGTCGAACGAAAAATACATTCCAAATAAATGCTTGCTTAAATCTCTA < NC_000913/2470483‑2470336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |