Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,088,193 | 0 | C | A | 97.3% | 453.5 / 0.9 | 151 | intergenic (+333/‑91) | metK/galP | S‑adenosylmethionine synthetase/D‑galactose transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/3); new base A (68/78); total (70/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TTCATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCT > NC_000913/3088050‑3088338 | ttCATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGAGATTa < 1:986829/149‑1 (MQ=255) cATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCGGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGAGATTaca > 1:1070019/1‑149 (MQ=255) atatTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGAGATTacac > 1:1180669/1‑149 (MQ=255) ttattattCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGATATTACACTGa 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |