Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,287,268 | 0 | C | A | 26.9% | 126.6 / 10.4 | 80 | noncoding (61/85 nt) | tyrV | tRNA‑Tyr |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/28); new base A (21/0); total (51/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTG > NC_000913/1287121‑1287416 | cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt > 1:657021/1‑149 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:238767/149‑1 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:981994/149‑1 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACtttg > 1:857984/1‑148 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa > 2:586213/1‑149 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa < 1:342501/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCAGCATGGGCAGATTATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAATTTCAAGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCAACCTTCGAAGt > 1:1459277/1‑149 (MQ=18) gCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACAATCGAAGTGGa > 1:1150621/1‑149 (MQ=255) ctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACGATTCTAAGTCGATGACg > 1:314375/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:1648480/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGACCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTAAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGCCGGCAGa > 2:1533348/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGTAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 1:437581/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt > 2:437581/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt > 2:796384/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 1:796384/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGa > 2:703184/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGa > 1:413870/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATACGAACCTTCGAAGTCGATGACgtaaaa > 2:858682/1‑144 (MQ=255) gcgcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAATTAATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACATTCTACGTCGATGACggataatt > 2:1125568/1‑143 (MQ=17) gcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTAGATGACGGCAGATTTa > 1:568319/1‑149 (MQ=255) gAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTAGAAGTAGATGACGGCAGATTTACAgg > 1:496756/1‑148 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACCTGCGAAGTCGATGACGGAAGATTGACAGTCt > 1:743436/1‑149 (MQ=255) tCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:1648480/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACTGTCTGCTCGCTTTggg > 2:26632/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 1:997079/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACATTCGAAGGCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTATGGc > 2:1303891/1‑149 (MQ=255) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGcc < 2:1217944/149‑1 (MQ=255) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACAATCTAAGAAGATGACCCAAGATTTAGAGTCTGCTCCAATTggac > 2:182554/1‑147 (MQ=17) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGTCCGCTc > 1:1591558/1‑149 (MQ=255) gCTTATAATCCTTCACCGCATCGGTAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc < 2:1459277/149‑1 (MQ=25) cTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg < 1:518794/149‑1 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCgg < 1:995525/149‑1 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACAATCGAACTCAATGCCTCCAGATTTAAATTCTTCTACCATTGGCAGCTCgt > 2:683814/1‑148 (MQ=17) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGCTTCGGGGGGAAGTTCAGTGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCAGGaa < 2:1249983/149‑1 (MQ=25) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTGGGGAAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:1058243/149‑1 (MQ=255) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTACCATTCGAAGTAGATGACGGAAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 2:193436/1‑149 (MQ=25) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTAGGACGCTCGGGAAcc > 1:274803/1‑149 (MQ=255) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCACCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 2:496083/1‑149 (MQ=255) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGCATATTTACTGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcca > 1:581515/1‑148 (MQ=255) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATACCAAGCTAAGAAGATCACGCCACATGTACAGTCACCTCCCAAAGGCCGCTCGGGAAccc > 2:855314/1‑149 (MQ=14) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac < 1:586213/149‑1 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTAGGACGCTCGGGAACCccccca > 2:551610/1‑149 (MQ=25) cGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggg > 1:480730/1‑149 (MQ=255) cGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTACAGTCGAAGGGGATCACCGCTCAGTGCCAGTCTGGTCCCATAGGCCGCTCGGGATCCccaccatcg > 2:138205/1‑146 (MQ=17) gCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg < 2:420977/149‑1 (MQ=255) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACATTCTAAGTCGATGACGCCACATTAACAGTCTGCTACCTTTGGACCCACGGGAACCCCACAAGGGGTAAtt > 2:1243475/1‑149 (MQ=21) cAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGACGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCCCCAGGGGTAATTCa > 1:170650/1‑149 (MQ=255) atatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAAtt > 1:1434742/1‑149 (MQ=255) tttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAGGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGTTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTg < 1:949846/149‑1 (MQ=255) ttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGa < 2:267528/149‑1 (MQ=255) ggATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACAATCTAAGTCGATGACGGCATATTTACAGTCTGCTCACTTTGGCCTCTCGGCAACCCAACCAGGGTTATATCAAATTTTGAGTTAAtta > 1:878968/1‑147 (MQ=21) aTTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCtt < 2:997079/149‑1 (MQ=255) tCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTga < 1:703184/149‑1 (MQ=255) ttGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACGTTCGAAGTAGATGACGGAACATTAACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCGCGGGAACCACACCAGGGGTAAGTCAAAGTTTGCGGTAAGGCTTGAGAt > 1:1212349/1‑149 (MQ=21) tGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCGAAGACGATCACGCAACATTTACAGTCAGCTCCCTTAGGACTCTCGGGAACCCCACCATGGGTAATTAAATTTTTGATGAAAACCTTTAGAtg > 1:161385/1‑149 (MQ=18) ggAAGTTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGATGTAATGATTGAGAtggt > 1:1635218/1‑149 (MQ=21) ggAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGACCATTCGAAGTCGATCACGGCAGAGTTACAGTCTGCTCCCGTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTTATGGTTGAGAtggt > 2:737769/1‑149 (MQ=21) aaGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGCAGAGTTACAGTCTGCTCCCTTAGGCCGCTCGGGAACGCCACCCGGGGTAATTAAACTTTTGAGGTAATGCTGGCGCtggtgg > 1:887506/1‑149 (MQ=18) aGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtggt < 2:480730/149‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa > 1:1115185/1‑51 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa < 2:1115185/51‑1 (MQ=255) gccTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGCCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:1577221/147‑1 (MQ=255) gACTTTTGATAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:1594562/149‑1 (MQ=255) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:858682/149‑1 (MQ=255) 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ttGCAAGTGATGGTTGGGGGGGAAGGATTCGATCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGTGAACCCCACCAGGGGTAATTCAATTTTTGATGTAATGCTAGAGATGGTGGGGGGGGAAGGatta < 1:347047/149‑1 (MQ=18) ttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACCATTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTGCCTTTGTCCTCTCGGGATCCCCACAAGGGGTAATTAATATTTTGATGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGatta > 1:848539/1‑149 (MQ=21) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGTACCTTCGTTGTCGATGACGGCAGTTTTACAGTATGCTCCCTTTGGCCGCTCGTGTACCCCACGATGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATtcgtc < 1:683814/149‑1 (MQ=25) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACATTCTAAGTCGCTCACGGCTGAGTTACAGTCTGCTCCCATTGGACGCTCGCGAACCCCCCCAGGGGTAATTAAAATTTTGAGGTAAAGCTTGACAGTGGGGTGGGGGAAGTTTTATtcgtcg > 2:797598/1‑149 (MQ=18) gtggGGAAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGctc < 1:735561/149‑1 (MQ=255) ggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAc > 2:549254/1‑149 (MQ=255) ggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAc > 2:928936/1‑149 (MQ=255) aaGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAccc > 1:441813/1‑149 (MQ=255) aGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCt > 1:799605/1‑149 (MQ=255) aTTCGAACCTGCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGTTAACCCCACCAGGGGTAATTCATATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCg < 1:182554/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTACTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCg > 1:605668/1‑149 (MQ=255) cccTTCGAAGTCGATGTCGGCAGATTTACAGTCTGCTCACATTGGCCGCTCTGGATCCCCAAGATGGGTAATTAAAATTATGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGGGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGt < 2:878968/148‑1 (MQ=37) aCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGt > 1:130734/1‑149 (MQ=255) cTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTg > 1:1036262/1‑149 (MQ=255) | CTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTG > NC_000913/1287121‑1287416 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |