Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_pae_tpiA | 4,604,632 | C→A | A186E (GCA→GAA) | bglJ → | bgl operon transcriptional activator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_pae_tpiA | 4,604,632 | 0 | C | A | 98.5% | 221.4 / NA | 68 | A186E (GCA→GAA) | bglJ | bgl operon transcriptional activator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (33/34); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GACCGACCGACTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGCACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTT > NC_000913_3_pae_tpiA/4604486‑4604776 | gcccgaacgaaTGAACAATCAGTGGCACCTTAAGCAAAACCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGGGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGaac < 1:210112/147‑1 (MQ=255) tGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAAt > 1:200087/1‑149 (MQ=255) aaCAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAAtgt > 2:169114/1‑149 (MQ=255) cAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGACAGAAATTCAGACGTGTATGTCGCGAGGTTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGa < 1:835637/149‑1 (MQ=255) aaTCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGGCGTTAAGCCCGCGGGGGAGCGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCACATTACAAGCAATATCAAAACGAACCGTGAAAATAAATTTAATGTGAt > 2:347307/1‑149 (MQ=255) aaTCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTCAGCCTAGGGGGTAGCGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCCGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGAt > 1:558301/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTc < 1:36494/149‑1 (MQ=255) ggTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGaaa < 1:811148/149‑1 (MQ=255) gTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAAc < 1:261427/149‑1 (MQ=255) aCATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTg < 1:424320/149‑1 (MQ=255) aCATTAACCAAAGCCGGACGGTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTg < 1:435456/149‑1 (MQ=255) cATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGCACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACtct > 2:268433/1‑147 (MQ=255) aTTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTggg > 2:196173/1‑149 (MQ=255) ttAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGc < 1:308288/149‑1 (MQ=255) ttAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAAATGGGc > 1:478167/1‑149 (MQ=255) ccAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCa < 2:335835/149‑1 (MQ=255) cAAAGCCCGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCATGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑g < 1:1111488/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAACTTTAATTTGATGTCGAAACTgggaggcggt > 1:257535/1‑142 (MQ=255) gcccGGACGTTAAGTCCGACGGAGAGTGAAATATTGCGGTTTATGTGGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTc < 2:938795/147‑1 (MQ=255) aggtgtggCCCGACGGAGAGAGAAAGAGTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAACCTGGGCGTCA‑GTTCTGACGc < 2:232832/142‑1 (MQ=255) ttAAGGCGGTCGGAGTGTGTAATGTTGCGCTTTATGTCGCGTGGTTACTCAATGACACAAATTGCCTAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATATATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAgg < 2:323256/149‑1 (MQ=255) tAAGCCCTACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAggg > 2:723266/1‑149 (MQ=255) ccGACGGGGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTGGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTAACTTTTTAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGgttgtt < 2:245361/149‑1 (MQ=255) agagagaAATATTGCGCTTTATGTAGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAATGCAATATCAAGACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGGTGTCGAAACTGGGCGTAC‑GTTCTTATGCAGGGTTGTTGGAGGcc > 2:631711/1‑149 (MQ=255) gagagaAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCg < 2:428542/149‑1 (MQ=255) agaAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTCGTTGGAGGCCGccg > 1:251282/1‑147 (MQ=255) gaAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGa < 1:169114/149‑1 (MQ=255) aaaTATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCG‑GTTCTGACCCAGGGTGGTTGGAGGCCGCAGat > 1:917664/1‑149 (MQ=255) atTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGGGGCCGCAGGTATTc > 2:489315/1‑149 (MQ=255) cgcTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGtt < 2:478167/149‑1 (MQ=255) cgcTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGtt < 1:999955/149‑1 (MQ=255) tttATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTCAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTTGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGCGGCACCAGATATTTTGTtatg > 2:171244/1‑149 (MQ=255) tttATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTc < 1:326413/142‑1 (MQ=255) tttATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTc > 2:326413/1‑142 (MQ=255) tATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatgta > 2:151524/1‑149 (MQ=255) gTCGTGTGGCTACTCAATGACAAAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGc < 2:97801/149‑1 (MQ=255) gTCGCGTGGCTACTCAATGACCCAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGc < 1:719468/149‑1 (MQ=255) gTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGGCGCAGGGTTGTTGGGGGCCGCAGATTTTGTGTTATGTATGTgggtt > 1:131941/1‑146 (MQ=255) gTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCAt > 2:778373/1‑149 (MQ=255) tGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCAtt < 2:562487/149‑1 (MQ=255) gCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGc < 1:910469/149‑1 (MQ=255) aaTGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACaa > 1:824011/1‑149 (MQ=255) tGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCCGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGt > 1:806099/1‑149 (MQ=255) tGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGCTATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGt > 1:186845/1‑149 (MQ=255) acacAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGATGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGCCATTGCGAAACAAGTaa > 2:375287/1‑149 (MQ=255) cacaAATTGCCAAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAt > 2:1069629/1‑149 (MQ=255) caAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGAAC‑GTGTGGACCCATGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAtgt < 1:787846/149‑1 (MQ=255) caAATGTCCGAGCAGCTTAATCGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTGA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAtgt < 2:954631/149‑1 (MQ=255) aaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCCGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATgtgt > 2:258226/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGtt > 1:945081/1‑149 (MQ=255) tagcaacTTAAACGCAATATCAAAATGATACGTGAAAATAATGTGGAGCTGATTGCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGCTGCAGGGTTGTTGTAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATcc < 2:690593/148‑1 (MQ=255) agcagcTTAAACGCCATAACAGAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATccc < 1:593868/149‑1 (MQ=255) cagcTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTa < 2:956313/149‑1 (MQ=255) agcTTAAACGCAACATCAAAACGATCCGTTAACATAAATTTACTGCGATGGCATAGCGGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGGATATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTAt < 1:723266/149‑1 (MQ=255) ttAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTaa > 1:952759/1‑149 (MQ=255) aaCGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGgttgtt > 1:1028874/1‑79 (MQ=255) aaCGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGgttgtt < 2:1028874/79‑1 (MQ=255) gCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGAAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGGTATTCTCTTATGTATGCGGCCTTGCGAAACAAGTACTGCATTGCATCCCTCTTAAACCgac > 2:1034783/1‑147 (MQ=255) gaaTATCAAAACGGTCCTTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCat < 2:53876/148‑1 (MQ=255) atCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGGCGCGAATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCatgatg > 2:695886/1‑149 (MQ=255) aaCGATCCGTGAACATGTGTTTGGTGTGATGTCGAAAC‑CGNCACCATGTGCTGACGCGGGACTGTCGGGTTCGTGAGATGGTCGGTGATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAANGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCggg > 2:1096299/1‑149 (MQ=255) aaCGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCggg > 2:799614/1‑149 (MQ=255) accctCCTTGAACATAAATTTAATGTGATGGCGAAACTGGGCGTTA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGAAGATATTCTGTTATGTATTCTGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGt < 1:171244/145‑1 (MQ=255) cGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGtt > 2:440388/1‑149 (MQ=255) acccGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTa < 1:456254/147‑1 (MQ=255) cGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTGATGTGTTGCATTCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACtt > 2:1066176/1‑149 (MQ=255) cGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACtt < 1:1139174/149‑1 (MQ=255) gTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCat > 2:663433/1‑132 (MQ=255) gTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCat < 1:663433/132‑1 (MQ=255) | GACCGACCGACTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGCGTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGCACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCA‑GTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTT > NC_000913_3_pae_tpiA/4604486‑4604776 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |