| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 913,852 | Δ1 bp | intergenic (‑38/+106) | hcp ← / ← lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 913,850 | 0 | T | . | 100.0% | 75.0 / NA | 17 | intergenic (‑36/+108) | hcp/lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (11/6); total (11/6) | |||||||||||
CCGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > NC_000913/913775‑913922 | ccGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGttaag < 1:173977/80‑4 (MQ=255) ggATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGc < 1:173978/81‑1 (MQ=255) gTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAAc < 2:173979/81‑1 (MQ=255) tGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAAcgcg > 1:173997/1‑81 (MQ=255) tGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAAcgcg > 2:174006/1‑81 (MQ=255) ttCACATTGCACACAAAACATGATCACACTTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCgg < 1:173980/80‑1 (MQ=255) ttCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCggg > 1:173992/1‑81 (MQ=255) tCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCggg > 2:173995/1‑80 (MQ=255) aTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATa > 1:174000/1‑80 (MQ=255) tGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAATTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATaa > 2:174001/1‑79 (MQ=255) cacacaAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAgg > 2:174004/1‑81 (MQ=255) acacaAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAggg < 2:173981/81‑1 (MQ=255) cTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACttt > 1:174005/1‑79 (MQ=255) ttAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAgg < 1:173982/80‑1 (MQ=255) aaGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAgg > 2:173999/1‑77 (MQ=255) aGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgat > 2:173996/1‑81 (MQ=255) tatTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgattgatt < 1:173983/81‑1 (MQ=255) tataCATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAgcgc > 2:174009/1‑80 (MQ=255) | CCGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > NC_000913/913775‑913922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |