| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 399,509 | T→C | intergenic (‑176/‑84) | yaiY ← / → yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 399,509 | 0 | T | C | 100.0% | 56.1 / NA | 16 | intergenic (‑176/‑84) | yaiY/yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (9/7); total (9/7) | |||||||||||
TGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACG > NC_000913/399437‑399584 | tGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAAt > 1:78087/1‑80 (MQ=255) ttCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTc < 1:78068/81‑1 (MQ=255) gAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTacac < 2:78069/81‑1 (MQ=255) gCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTAcaccac < 2:78070/81‑1 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTAcacca > 2:78080/1‑78 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAg < 2:78071/81‑1 (MQ=255) gTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGttgttg > 1:78086/1‑81 (MQ=255) gAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGaa > 2:78090/1‑81 (MQ=255) aaaaTGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCaa < 1:78072/81‑1 (MQ=255) aaGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGttttt < 1:78073/80‑1 (MQ=255) aaaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTaa > 1:78099/1‑81 (MQ=255) aaaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTaa > 2:78104/1‑81 (MQ=255) aaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAc > 1:78097/1‑81 (MQ=255) aaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAc < 2:78074/81‑1 (MQ=255) aaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAc > 2:78103/1‑81 (MQ=255) tttACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACg > 1:78098/1‑80 (MQ=255) | TGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACG > NC_000913/399437‑399584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |