| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 913,852 | Δ1 bp | intergenic (‑38/+106) | hcp ← / ← lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 913,850 | 0 | T | . | 100.0% | 63.8 / NA | 16 | intergenic (‑36/+108) | hcp/lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (8/8); total (8/8) | |||||||||||
GGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGCAAT > NC_000913/913777‑913925 | ggAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGtt < 1:172161/81‑1 (MQ=255) gTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTaa < 1:172162/80‑1 (MQ=255) cacaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGa > 2:172187/1‑81 (MQ=255) cacaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGa > 2:172188/1‑81 (MQ=255) caTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAGAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATa < 2:172163/81‑1 (MQ=255) aaaaCATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGAttt > 1:172192/1‑81 (MQ=255) aCATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTc < 2:172164/81‑1 (MQ=255) aTGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCAt < 1:172165/81‑1 (MQ=255) tGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATg < 2:172166/81‑1 (MQ=255) tGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATg > 2:172185/1‑81 (MQ=255) tCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCaa < 1:172167/81‑1 (MQ=255) ccTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACtgt > 2:172186/1‑78 (MQ=255) ttAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAgg > 2:172196/1‑80 (MQ=255) ttAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAg < 2:172168/79‑1 (MQ=255) ttAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAg > 2:172195/1‑81 (MQ=255) taCATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGCAAt > 1:172190/1‑81 (MQ=255) | GGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGCAAT > NC_000913/913777‑913925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |