Predicted mutation
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RA	NC_000913	150,562	A→G	I131T (ATA→ACA)	yadC ←	fimbrial tip‑adhesin YadC

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	150,562	0	A	G	100.0%	79.7 / NA	24	I131T (ATA→ACA)	yadC	fimbrial tip‑adhesin YadC
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (9/15);  total (9/15)

TTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGAC  >  NC_000913/150487‑150638                                                                            |                                                                             ttggAAGGATCCCCGATATAGATTCTTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTaa                                                                          >  2:33019/1‑80 (MQ=255)       ggATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGgtg                                                                   <  1:32982/81‑1 (MQ=255)              cGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAAt                                                               <  1:32983/78‑1 (MQ=255)               gATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAg                                                           <  2:32984/81‑1 (MQ=255)                     gATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAg                                                      >  2:33018/1‑80 (MQ=255)                     gATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAg                                                      >  1:33015/1‑80 (MQ=255)                      aTTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGa                                                    <  2:32986/81‑1 (MQ=255)                      aTTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGa                                                    <  2:32985/81‑1 (MQ=255)                          cTGGCGGTTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTGTCATGATGTAATACAGACCAGGAACAg                                                <  2:32987/81‑1 (MQ=255)                          cTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACa                                                 <  1:32988/80‑1 (MQ=255)                            ggCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGAt                                              >  1:33025/1‑81 (MQ=255)                             gCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATg                                             <  2:32989/81‑1 (MQ=255)                                 ttGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTAt                                          >  2:33026/1‑80 (MQ=255)                                  tGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTAtt                                         >  1:33022/1‑80 (MQ=255)                                        tCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGt                                  >  2:33021/1‑81 (MQ=255)                                          aGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGttt                                <  2:32990/81‑1 (MQ=255)                                              aTTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATg                             <  1:32992/80‑1 (MQ=255)                                              aTTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATg                             <  1:32991/80‑1 (MQ=255)                                                      gTATGCAGACCAGACCCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCAt                     <  1:32993/80‑1 (MQ=255)                                                              accagaccCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTAc            <  1:32994/81‑1 (MQ=255)                                                                 agaccCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTg         <  1:32995/81‑1 (MQ=255)                                                                   accCTTGATGTTAACATGGTGTAATACAGACAAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGaa       <  1:32996/81‑1 (MQ=255)                                                                        tGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGAc  >  1:33024/1‑81 (MQ=255)                                                                        tGATGTTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGAc  >  2:33036/1‑81 (MQ=255)                                                                            |                                                                             TTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGAC  >  NC_000913/150487‑150638

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑