| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,413,532 | T→A | *70L (TAA→TTA) | rcbA ← | Rac prophage; double‑strand break reduction protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,413,532 | 0 | T | A | 100.0% | 42.6 / NA | 13 | *70L (TAA→TTA) | rcbA | Rac prophage; double‑strand break reduction protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (6/7); total (6/7) | |||||||||||
CATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCT > NC_000913/1413455‑1413606 | cATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAAt > 2:243898/1‑81 (MQ=255) aTCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAAtt > 1:243897/1‑81 (MQ=255) gCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAAt < 2:243874/81‑1 (MQ=255) gCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAAt > 2:243892/1‑81 (MQ=255) gcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAAtt < 2:243875/81‑1 (MQ=255) aaTGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATtctc > 1:243891/1‑81 (MQ=255) tAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGa > 1:243890/1‑81 (MQ=255) aCGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTtctc < 1:243876/80‑1 (MQ=255) cGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGc < 1:243878/81‑1 (MQ=255) cGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGc < 2:243877/81‑1 (MQ=255) ccGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAAt < 1:243879/81‑1 (MQ=255) ataatCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGttt < 2:243880/81‑1 (MQ=255) aaGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGctct > 2:243901/1‑81 (MQ=255) | CATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCT > NC_000913/1413455‑1413606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |