| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,693,373 | G→C | A724G (GCC→GGC) | purL ← | phosphoribosylformylglycinamide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,693,373 | 0 | G | C | 97.2% | 121.3 / ‑4.8 | 36 | A724G (GCC→GGC) | purL | phosphoribosylformylglycinamide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (18/17); minor base A (0/1); total (18/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCACCAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGGCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGCTC > NC_000913/2693298‑2693449 | tCACCAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATg > 1:431702/1‑81 (MQ=255)tCACCAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATg > 1:431704/1‑81 (MQ=255) cACCAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATg < 2:431638/80‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTg < 2:431639/81‑1 (MQ=255) ggTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGtt > 1:431682/1‑80 (MQ=255) gCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGc > 2:431707/1‑81 (MQ=255) ccTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCt < 2:431640/81‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCtt < 2:431641/81‑1 (MQ=255) gccgccgccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCa > 1:431697/1‑81 (MQ=255) ccgccgccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCac < 2:431643/81‑1 (MQ=255) ccgccgccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCac < 2:431642/81‑1 (MQ=255) cgccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCaccgac < 1:431644/81‑1 (MQ=255) gccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCaccgacc < 1:431645/81‑1 (MQ=255) gccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCaccgacc > 2:431720/1‑81 (MQ=255) gccATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCaccgacc > 2:431699/1‑81 (MQ=255) aTCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGc > 2:431705/1‑80 (MQ=255) tCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGc > 2:431687/1‑79 (MQ=255) aGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGAc < 2:431646/81‑1 (MQ=255) gCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGc < 1:431647/80‑1 (MQ=255) gCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGc < 1:431648/80‑1 (MQ=255) ttGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAggcggc > 2:431692/1‑80 (MQ=255) tGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGgcggcg < 1:431649/80‑1 (MQ=255) tGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGgcggcg > 2:431695/1‑80 (MQ=255) gCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATc > 2:431708/1‑81 (MQ=255) cGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATcc < 1:431650/81‑1 (MQ=255) gATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCcagcag > 2:431703/1‑81 (MQ=255) gATATCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCcagcag > 1:431710/1‑81 (MQ=255) tCGCCAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCa < 2:431651/81‑1 (MQ=255) cAATTTGTGTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCg < 2:431652/81‑1 (MQ=255) tgtgTTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCa > 1:431701/1‑81 (MQ=255) tgtTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCAc < 1:431653/80‑1 (MQ=255) cgtTGCGAGGATGTTGGGCAACGCTTTACCGCCCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAACTCCATAAGTGCAAACGGAGAACg < 2:431657/80‑1 (MQ=255) gtTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGc > 1:431696/1‑81 (MQ=255) gtTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGc > 1:431698/1‑81 (MQ=255) gtTGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGc > 2:431750/1‑81 (MQ=255) ttGCGCCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGc < 2:431654/80‑1 (MQ=255) gcgccgATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGCTc < 1:431655/80‑1 (MQ=255) | TCACCAGGGTGGCCTGCCGCCGCCATCCAGTTGGCGGAAAGTTTGATGCGTTTGATATCGCCAATTTGTGTTGCGGCGATGTTGGTTAACGCTTCACCGACCGCCAGACGGGCAGAGGCGGCGAAATCCAGCAGCGCAACCGGCGCACGCTC > NC_000913/2693298‑2693449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |