| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 29,204 | T→C | intergenic (+9/‑447) | dapB → / → carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,204 | 0 | T | C | 100.0% | 63.2 / NA | 19 | intergenic (+9/‑447) | dapB/carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (5/14); total (5/14) | |||||||||||
TTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTT > NC_000913/29126‑29278 | tttGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAacat > 1:6419/1‑81 (MQ=255) tgGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGt > 1:6424/1‑81 (MQ=255) aGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGt < 1:6385/81‑1 (MQ=255) tGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGc < 2:6386/81‑1 (MQ=255) aGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAaca > 2:6414/1‑81 (MQ=255) ggTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACat < 2:6387/81‑1 (MQ=255) ggTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACat > 1:6422/1‑81 (MQ=255) gTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACatt < 2:6388/81‑1 (MQ=255) tGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGAt < 2:6389/81‑1 (MQ=255) gagaTGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATtat < 1:6390/81‑1 (MQ=255) aTGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATtata > 1:6417/1‑79 (MQ=255) tACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAgg < 2:6391/80‑1 (MQ=255) gATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCttt < 2:6392/80‑1 (MQ=255) gATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCtt < 2:6393/79‑1 (MQ=255) aataatTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAttttt < 2:6395/81‑1 (MQ=255) aataatTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAtt < 1:6394/78‑1 (MQ=255) tGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCt < 2:6396/80‑1 (MQ=255) tAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCtttt < 1:6397/81‑1 (MQ=255) aCCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAt < 2:6398/81‑1 (MQ=255) acaAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAtttt > 1:6423/1‑81 (MQ=255) | TTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTT > NC_000913/29126‑29278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |