| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 728,969 | Δ1 bp | intergenic (‑148/‑165) | kdpF ← / → ybfA | K(+) transporting P‑type ATPase subunit KdpF/DUF2517 domain‑containing protein YbfA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 728,966 | 0 | T | . | 100.0% | 32.4 / NA | 9 | intergenic (‑145/‑168) | kdpF/ybfA | K(+) transporting P‑type ATPase subunit KdpF/DUF2517 domain‑containing protein YbfA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (5/4); total (5/4) | |||||||||||
AAAATCTGCGGGCGGGGTGTAAAAAAAGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAACTTTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGTCGGATGAGTAGTA > NC_000913/728887‑729040 | aaaaTCTGCGGGCGGGGTGTAAAAAAAGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAACtt > 2:155801/1‑81 (MQ=255) aTCTGCGGGCGGGGTGTAAAAAAAGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAACtttgt > 2:155798/1‑79 (MQ=255) gggcgggGTGTAAAAAAAGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACt < 1:155787/81‑1 (MQ=255) aaaaaaaGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGa > 2:155800/1‑81 (MQ=255) aaaaaTGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGtaaa > 1:155805/1‑80 (MQ=255) tGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAAcc < 1:155788/81‑1 (MQ=255) aaaGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCaa > 1:155806/1‑81 (MQ=255) aTGTTTAGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGt > 1:155807/1‑81 (MQ=255) aGTATTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGTCGGAt < 2:155789/80‑1 (MQ=255) aTTAATTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGTCGGATGag > 2:155812/1‑80 (MQ=255) aTTTAAC‑TTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGTCGGATGAgtagta < 2:155790/81‑1 (MQ=255) | AAAATCTGCGGGCGGGGTGTAAAAAAAGTATAAAAATGGCAAAAGCCATGATTTAACTAATGTTTAGTATTAATTTAACTTTTGTGTAACTTAATTACAGGATGAATGTAAATAAACCATCAATAAGCAAAAATAAGTGGTCGGATGAGTAGTA > NC_000913/728887‑729040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |