Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 78,635 | (G)5→4 | coding (1015/1179 nt) | setA → | sugar exporter SetA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 78,631 | 0 | G | . | 100.0% | 66.5 / NA | 17 | coding (1011/1179 nt) | setA | sugar exporter SetA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (6/11); total (6/11) |
TTAACGCTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGCGGGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCGGGGTAATTCTGGCTGGCGTTATTCAGGGAGCAATTG > NC_000913/78558‑78707 | ttAACGCTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGCggggcag < 2:19239/80‑4 (MQ=255) aaCGCTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTa > 1:19277/1‑81 (MQ=255) aCGCTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTa < 1:19240/80‑1 (MQ=255) cTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTaccac < 1:19241/81‑1 (MQ=255) tATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCtt < 1:19242/81‑1 (MQ=255) aTCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTAttt < 2:19243/80‑1 (MQ=255) tCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTAc < 1:19244/81‑1 (MQ=255) cGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTAc > 2:19274/1‑80 (MQ=255) ggCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGATACCACCTTATTTACTa < 2:19245/81‑1 (MQ=255) gCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTaa > 1:19263/1‑81 (MQ=255) cATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTaa > 2:19275/1‑80 (MQ=255) ggTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTa < 2:19246/81‑1 (MQ=255) gTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTAc > 1:19280/1‑81 (MQ=255) tATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTAcc < 2:19247/81‑1 (MQ=255) tGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCggg > 2:19281/1‑81 (MQ=255) tGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCGGGGTAATTctgg < 1:19248/81‑1 (MQ=255) gTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCGGGGTAATTctggct < 2:19249/81‑1 (MQ=255) agagC‑GGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCGGGGTAATTCTGGCTGGCGTTATTCAGGGAGCAATTg < 2:19250/81‑1 (MQ=255) | TTAACGCTGTATTTATCGGCATTGTTGCGGGTATTGGGATGCTATGGTTTCAGGATTTAATGCCTGGAAGAGCGGGGGCAGCTACCACCTTATTTACTAACAGTATTTCTACCGGGGTAATTCTGGCTGGCGTTATTCAGGGAGCAATTG > NC_000913/78558‑78707 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |