| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,214,175 | A→G | intergenic (‑116/+89) | bluR ← / ← bluF | DNA‑binding transcriptional repressor BluR/blue light‑responsive regulator of BluR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,214,175 | 0 | A | G | 100.0% | 54.1 / NA | 17 | intergenic (‑116/+89) | bluR/bluF | DNA‑binding transcriptional repressor BluR/blue light‑responsive regulator of BluR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (9/8); total (9/8) | |||||||||||
ATAATACTTTGTACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAACATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGATTTACTGAAATCATGTGAA > NC_000913/1214106‑1214248 | ataataCTTTGTACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTa < 2:240304/81‑1 (MQ=255) taataCTTTGTACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTaa < 1:240305/81‑1 (MQ=255) cTTTGTACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAAtgtg < 2:240306/80‑1 (MQ=255) tACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTaa < 1:240307/81‑1 (MQ=255) atatACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAAttt < 2:240308/81‑1 (MQ=255) gCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAaacg > 2:240340/1‑80 (MQ=255) aaaTTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAaacgtaacg > 2:240330/1‑81 (MQ=255) aaTTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAaacgtaacgt < 2:240309/81‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAacgtaacgta > 2:240333/1‑81 (MQ=255) tgtgCAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTAtt > 2:240324/1‑81 (MQ=255) gTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTAtt > 2:240325/1‑80 (MQ=255) aCAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCAt > 1:240323/1‑81 (MQ=255) aaGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCAtttt > 1:240322/1‑81 (MQ=255) aaGATTTCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGAtt > 2:240328/1‑81 (MQ=255) ttCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGATTTACt > 1:240320/1‑80 (MQ=255) tCAGCTAAATTGGATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGATTTACTg < 2:240310/80‑1 (MQ=255) gATGAAGCATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGATTTACTGAAATCATGTGaa < 1:240311/80‑1 (MQ=255) | ATAATACTTTGTACAATATACGCTAAAATTGTACAAAGTATAAATAAGATTTCAGCTAAATTGGATGAAACATTATTTTTAATGTGGATTAAATTTAAACGTAACGTATTCATTTTCACGATGATTTACTGAAATCATGTGAA > NC_000913/1214106‑1214248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |