Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,413,532 | T→A | *70L (TAA→TTA) | rcbA ← | Rac prophage; double‑strand break reduction protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,413,532 | 0 | T | A | 100.0% | 50.5 / NA | 15 | *70L (TAA→TTA) | rcbA | Rac prophage; double‑strand break reduction protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (6/9); total (6/9) |
ATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTC > NC_000913/1413456‑1413605 | aTCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAAtt > 1:270255/1‑81 (MQ=255) ggCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACaa > 1:270259/1‑81 (MQ=255) ttAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAgg < 1:270241/81‑1 (MQ=255) gACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACt < 2:270242/81‑1 (MQ=255) aaTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGtt < 2:270243/81‑1 (MQ=255) aCGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTtctc < 1:270244/80‑1 (MQ=255) ccGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAAt < 1:270245/81‑1 (MQ=255) gATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAAtt > 1:270262/1‑80 (MQ=255) attattAATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAAttt < 1:270246/80‑1 (MQ=255) attaATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAt > 2:270260/1‑79 (MQ=255) ttaATAATCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAg < 1:270247/81‑1 (MQ=255) taataaTCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGt > 1:270257/1‑81 (MQ=255) tCAGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACt > 1:270265/1‑81 (MQ=255) aGCTATGAAGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACtt < 2:270248/80‑1 (MQ=255) aaGTTTAAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGctc < 2:270249/80‑1 (MQ=255) | ATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTC > NC_000913/1413456‑1413605 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |