Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,962,324 | T→C | V118A (GTT→GCT) | yecT → | protein YecT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,962,324 | 0 | T | C | 100.0% | 54.9 / NA | 17 | V118A (GTT→GCT) | yecT | protein YecT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (7/10); total (7/10) |
CTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCG > NC_000913/1962251‑1962399 | cTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGa < 2:349747/80‑1 (MQ=255) tAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGAtt > 1:349766/1‑80 (MQ=255) aGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCtt < 1:349748/81‑1 (MQ=255) cGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTAt < 2:349749/81‑1 (MQ=255) gAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTAtt < 2:349750/81‑1 (MQ=255) aGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTc > 2:349777/1‑81 (MQ=255) ccTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTg < 1:349751/81‑1 (MQ=255) ggATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAg > 1:349774/1‑80 (MQ=255) ggATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAg > 2:349772/1‑80 (MQ=255) aTTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAAt < 2:349752/81‑1 (MQ=255) ttttAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATg < 1:349753/81‑1 (MQ=255) tAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGc < 1:349754/80‑1 (MQ=255) ggACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCtctc < 2:349755/81‑1 (MQ=255) aTCCTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGAc > 2:349779/1‑80 (MQ=255) cTTTCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCaa > 1:349775/1‑80 (MQ=255) tCAAATGAGGACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATa < 1:349756/79‑1 (MQ=255) ggACGCTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCg > 1:349782/1‑81 (MQ=255) | CTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCG > NC_000913/1962251‑1962399 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |