| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 29,204 | T→C | intergenic (+9/‑447) | dapB → / → carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,204 | 0 | T | C | 100.0% | 77.2 / NA | 23 | intergenic (+9/‑447) | dapB/carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (8/15); total (8/15) | |||||||||||
TGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTT > NC_000913/29130‑29279 | tgGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGt < 1:6966/81‑1 (MQ=255) gTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGt > 2:7002/1‑79 (MQ=255) ttGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTAt < 1:6967/81‑1 (MQ=255) ttGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTAt < 1:6968/81‑1 (MQ=255) gAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATg < 1:6969/80‑1 (MQ=255) aGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCaaaaa < 2:6970/81‑1 (MQ=255) ggAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCaaaaa > 1:6991/1‑80 (MQ=255) aGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAaca > 1:6997/1‑81 (MQ=255) aGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAaca > 1:6999/1‑81 (MQ=255) cGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAAcaca > 2:7003/1‑81 (MQ=255) tCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACattt < 1:6971/81‑1 (MQ=255) atatGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTAtt < 1:6972/81‑1 (MQ=255) cGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGAtt < 1:6974/80‑1 (MQ=255) cGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATta < 1:6973/81‑1 (MQ=255) gagaTGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATtat < 1:6975/81‑1 (MQ=255) aCTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGc > 2:7008/1‑81 (MQ=255) cTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCt < 2:6976/81‑1 (MQ=255) tGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCtt > 1:7001/1‑80 (MQ=255) aTCTCAATAATTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTa < 2:6977/80‑1 (MQ=255) atTTGTAACCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGcc > 1:7004/1‑81 (MQ=255) aCCACAAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAt < 1:6978/81‑1 (MQ=255) acaAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAtttt < 1:6979/81‑1 (MQ=255) caAAACATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAttttt < 2:6980/81‑1 (MQ=255) | TGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTT > NC_000913/29130‑29279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |