Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 293,374 | A→G | V182A (GTT→GCT) | yagL ← | CP4‑6 prophage; resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 293,374 | 0 | A | G | 100.0% | 73.4 / NA | 22 | V182A (GTT→GCT) | yagL | CP4‑6 prophage; resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/10); total (12/10) |
GAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAA > NC_000913/293297‑293445 | gAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCAt > 2:68282/1‑81 (MQ=255) aaaTCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTc > 1:68277/1‑80 (MQ=255) cACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATc > 2:68286/1‑81 (MQ=255) cACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATc > 2:68272/1‑81 (MQ=255) aCCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCg > 2:68284/1‑81 (MQ=255) ttCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCtt > 2:68281/1‑81 (MQ=255) aGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGtt > 2:68280/1‑81 (MQ=255) ttGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGAtt < 2:68244/81‑1 (MQ=255) ttGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGAt < 2:68243/80‑1 (MQ=255) gtgATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGAttt < 1:68245/80‑1 (MQ=255) tgATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTc < 2:68246/80‑1 (MQ=255) gATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGAttt > 1:68279/1‑78 (MQ=255) aCGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATtgt < 1:68247/80‑1 (MQ=255) ggTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGt > 2:68291/1‑81 (MQ=255) ggTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGt > 2:68278/1‑81 (MQ=255) tttGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAAt < 1:68248/81‑1 (MQ=255) tGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATc < 1:68249/80‑1 (MQ=255) gCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCg < 2:68250/80‑1 (MQ=255) cTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGt < 2:68251/80‑1 (MQ=255) tcctTTCGTCCTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGa > 2:68290/1‑81 (MQ=255) ccTAATTTTTTCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAAt > 2:68293/1‑80 (MQ=255) ttttCTTAGCATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCaaaaaa < 2:68252/80‑1 (MQ=255) | GAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAA > NC_000913/293297‑293445 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |