| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 311,801 | G→A | intergenic (‑465/‑311) | ecpR ← / → ykgL | DNA‑binding transcriptional dual regulator MatA/uncharacterized protein YkgL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 311,801 | 0 | G | A | 100.0% | 68.0 / NA | 20 | intergenic (‑465/‑311) | ecpR/ykgL | DNA‑binding transcriptional dual regulator MatA/uncharacterized protein YkgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (15/5); total (15/5) | |||||||||||
GGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGG > NC_000913/311724‑311878 | ggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCg > 1:71960/1‑81 (MQ=255) aTAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGca > 2:71964/1‑81 (MQ=255) aaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTa > 1:71963/1‑81 (MQ=255) tgatgaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGgt < 1:71934/81‑1 (MQ=255) gaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGtt > 1:71952/1‑80 (MQ=255) gCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCAt < 1:71935/81‑1 (MQ=255) gCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCAt < 2:71936/81‑1 (MQ=255) aaGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGt < 1:71937/81‑1 (MQ=255) tgatTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATg > 1:71969/1‑81 (MQ=255) gatTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATg > 2:71957/1‑80 (MQ=255) tGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGaaaa > 1:71970/1‑81 (MQ=255) cAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt > 1:71967/1‑80 (MQ=255) cAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt > 1:71965/1‑80 (MQ=255) tCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAAc > 2:71974/1‑81 (MQ=255) cAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACg > 2:71971/1‑81 (MQ=255) aGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACgg > 1:71966/1‑81 (MQ=255) ttAATGGATTAACATACCGAACAAAATGGTTACAGGGGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTAc < 2:71938/80‑1 (MQ=255) tGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCAt > 2:71968/1‑81 (MQ=255) ggATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATc > 2:71976/1‑81 (MQ=255) cATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCgg > 2:71979/1‑81 (MQ=255) | GGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGG > NC_000913/311724‑311878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |