Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 399,509 | T→C | intergenic (‑176/‑84) | yaiY ← / → yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 399,509 | 0 | T | C | 100.0% | 65.3 / NA | 20 | intergenic (‑176/‑84) | yaiY/yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/10); total (10/10) |
TAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACG > NC_000913/399432‑399584 | tAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCTCAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTaa > 2:90301/1‑81 (MQ=255) aTTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACaa > 2:90291/1‑81 (MQ=255) tGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACg < 2:90265/81‑1 (MQ=255) gggAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGaaa < 2:90266/80‑1 (MQ=255) tatTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAAtgttg < 2:90267/81‑1 (MQ=255) atTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAAtgttgt > 1:90290/1‑81 (MQ=255) ttCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTc > 1:90294/1‑81 (MQ=255) gAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGAc > 1:90295/1‑81 (MQ=255) tgtgAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGttgttg > 2:90315/1‑79 (MQ=255) gtgAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGttgttg > 2:90297/1‑78 (MQ=255) aGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAat < 1:90268/81‑1 (MQ=255) aTGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGa > 1:90296/1‑81 (MQ=255) aaCCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGAtgttg < 2:90269/81‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGttt < 2:90270/81‑1 (MQ=255) aaGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGttttt < 1:90271/80‑1 (MQ=255) aaGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTc > 2:90303/1‑81 (MQ=255) aGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTc < 1:90272/80‑1 (MQ=255) ttAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGt > 2:90304/1‑80 (MQ=255) aaaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTa < 1:90273/80‑1 (MQ=255) aTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACg < 1:90274/81‑1 (MQ=255) | TAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACG > NC_000913/399432‑399584 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |