Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 570,248 | A→G | L449L (TTA→TTG) | ybcK → | DLP12 prophage; putative recombinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 570,248 | 0 | A | G | 100.0% | 44.0 / NA | 14 | L449L (TTA→TTG) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (5/9); total (5/9) |
ACTTTGAAGAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTATGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCTGTGATATC > NC_000913/570171‑570317 | aCTTTGAAGAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGc < 1:125463/81‑1 (MQ=255) cTTTGAAGAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGcc < 2:125464/81‑1 (MQ=255) tttGAAGAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCg > 1:125485/1‑81 (MQ=255) aaGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGcc < 1:125466/80‑1 (MQ=255) aaGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCt < 1:125465/81‑1 (MQ=255) ttcaGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGa > 2:125491/1‑80 (MQ=255) tttATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCAtaa > 1:125493/1‑81 (MQ=255) ttGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATAc < 2:125467/79‑1 (MQ=255) gACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGa > 2:125497/1‑80 (MQ=255) aaaaTGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCtgtg < 2:688861/81‑1 (MQ=255) aaaaTGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCtgt < 1:125468/80‑1 (MQ=255) aaTGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCTGTGat < 2:125469/81‑1 (MQ=255) aTGGACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCTGTGata < 2:125470/81‑1 (MQ=255) ggACGAGAGTTGTGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCTGTGATATc > 1:125492/1‑81 (MQ=255) | ACTTTGAAGAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGAGAGTTATGCCGTACACTTGCCTATAAAACATTCGAAAAAATCATAATTAATACGGATAATAAAACCTGTGATATC > NC_000913/570171‑570317 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |