| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 913,852 | Δ1 bp | intergenic (‑38/+106) | hcp ← / ← lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 913,850 | 0 | T | . | 100.0% | 49.7 / NA | 12 | intergenic (‑36/+108) | hcp/lysO | protein S‑nitrosylase/L‑lysine exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (7/5); total (7/5) | |||||||||||
TCCTGCCGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > NC_000913/913770‑913922 | tCCTGCCGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGt > 1:175035/1‑81 (MQ=255) aGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGtt > 2:175021/1‑79 (MQ=255) aCGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGAc > 1:175027/1‑81 (MQ=255) cGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACg < 2:175005/81‑1 (MQ=255) gTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAAc < 2:175006/81‑1 (MQ=255) tGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATg > 2:175031/1‑81 (MQ=255) tCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCaa > 1:175024/1‑81 (MQ=255) acacCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAAc < 1:175007/80‑1 (MQ=255) acCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACttt < 1:175008/81‑1 (MQ=255) tttAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTa < 2:175009/81‑1 (MQ=255) tAATATACATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAgc > 2:175037/1‑81 (MQ=255) tataCATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAgcgc > 1:175025/1‑80 (MQ=255) tataCATG‑TTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAgcgc > 1:175028/1‑80 (MQ=255) | TCCTGCCGGAGTACGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > NC_000913/913770‑913922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |