Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,260,779 | T→C | K211R (AAA→AGA) | fruA ← | fructose‑specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,260,779 | 0 | T | C | 100.0% | 70.0 / NA | 20 | K211R (AAA→AGA) | fruA | fructose‑specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (14/6); total (14/6) |
ATGTAAGAAACGCCCGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTTTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGTTTTCTTCAGCGCCAGA > NC_000913/2260701‑2260853 | aTGTAAGAAACGCCCGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTg > 2:370186/1‑81 (MQ=255) gAAACGCCCGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCccgcc < 2:370140/81‑1 (MQ=255) aaCGCCCGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCgg > 1:370185/1‑81 (MQ=255) cGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATa > 1:370179/1‑81 (MQ=255) cGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATa > 1:370181/1‑81 (MQ=255) cGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATa < 2:370141/81‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATAc < 2:370142/81‑1 (MQ=255) aGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGc < 1:370143/81‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCaa > 1:370184/1‑81 (MQ=255) gcCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGc > 2:370174/1‑81 (MQ=255) cACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTAt > 2:370180/1‑81 (MQ=255) tttcttACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAg < 1:370144/78‑1 (MQ=255) cttACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTg > 2:370178/1‑81 (MQ=255) aCTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTgc < 1:370145/79‑1 (MQ=255) ttCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGt > 1:370175/1‑81 (MQ=255) ttCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGt > 2:370182/1‑81 (MQ=255) tCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGtt > 1:370198/1‑81 (MQ=255) aGTGGTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGtttt > 1:370177/1‑81 (MQ=255) ggTCGCCGTTTGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGTTttctt > 1:370194/1‑81 (MQ=255) tGAGCTCTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGTTTTCTTCAGCGCCAGa > 1:370189/1‑81 (MQ=255) | ATGTAAGAAACGCCCGTCAGCAAGTGACGGTATGCGCCTGCACTCTCTTTCTTACTTTCAGTGGTCGCCGTTTGAGCTTTGCCCGCCGGTTCATACGGCGTTGCTTCAGCAACCGCTTTATCCAGTTCCTGCGCGGTTTTCTTCAGCGCCAGA > NC_000913/2260701‑2260853 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |